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本文以草鱼肝脏和肾脏为实验材料,采用Oligo(dT)引物定向克隆技术构建了草鱼肝肾脏组织的cDNA文库,随机对其中510个克隆测序并利用生物信息学方法对这些序列进行了初步的分类分析。
首先,利用TRIzol法抽提草鱼肝肾脏组织总RNA,用OligotexmRNAKits从总RNA中分离纯化富含Poly(A)的mRNA。反转录合成单链cDNA,PCR扩增得到双链cDNA,连接EcoRI接头,末端磷酸化,SfiI消化,回收双末端黏性化的双链cDNA。筛选收集大于500bp的cDNA片段,加工后与pBluesenptllsK(+)vector连接,转入DH-5α宿主菌。挑取阳性克隆,做菌液PCR检测,文库库容量为1.15×106,重组率达94%。所构建的cDNA文库容量符合今后的研究要求。
测序得到草鱼510个的cDNA序列,长度约为410-840bp,共315个Unigene。其中已知功能的基因有150个,主要与转录调节、翻译、核糖体结构、生物合成、细胞分裂、免疫、生长发育、生殖、特殊刺激、蛋白质的修饰和降解、生理调节、细胞膜结构、细胞内物质运输、细胞信号转导、物质代谢等有关。最后对全长基因进行了初步的结构和功能的分析。
本文构建了草鱼肝肾cDNA文库,可以方便地从中筛选所需目的基因,更重要的是可以用于分离全长基因进而开展基因功能研究。