肺结核患者外周γδT细胞Vδ2-CDR3序列特征及其合成多肽结合抗原肽的筛选和鉴定

来源 :蚌埠医学院 | 被引量 : 2次 | 上传用户:bosigai
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景:许多研究已证实γδ T细胞在抗结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis, Mtb)感染免疫中发挥重要作用。人γδ T细胞受体(TCRγδ)主要由Vγ9和Vδ2组成,在健康人外周血γδ T细胞中约80%为Vγ9δ2T细胞,已发现活动性结核病(TB)患者的外周Vγ9δ2T细胞数量和对Mtb抗原刺激的增殖活性均有明显降低。但是这类Vγ9δ2T细胞亚群在抗原识别以及克隆特征方面在TB患者和健康人之间有何不同,至今了解尚不完全。鉴于TCRγδ的γ或δ链V区的互补决定簇区3(CDR3)是识别抗原表位的关键位点,而目前对于TCRγδ所识别的Mtb抗原多肽表位也不完全清楚。因此从检测和分析TB患者γδ T细胞Vδ-CDR3基因谱型和序列特征,有助于理解γδ T细胞在抗原识别方面的克隆特征。另外根据TB患者的优势CDR3片段序列合成的肽片段,从噬菌体多肽展示库中筛选出Mtb相关性性的抗原表位。将有助于揭示γδ T细胞识别Mtb抗原表位的机制,为Mtb感染的诊断和防治提供新的方法。目的:检测和分析活动性肺TB患者外周血γδT细胞受体Vδ2链CDR3片段基因谱型和序列特征,应用Vδ2-CDR3优势片段序列合成肽在噬菌体多肽展示库中筛选Mtb抗原相关的多肽表位,并对合成的Mtb抗原多肽表位的激活人γδ T细胞活性进行初步鉴定。为阐明TB患者的T细胞免疫应答机制以及免疫诊断和治疗研究提供新的科学依据。方法:1.采集肺TB患者(n=27)和健康人(n=25)外周血分离PBMC提取RNA,用RT-PCR方法扩增TCRγδ的Vδ2基因CDR3片段,PCR产物通过基因扫描分析CDR3片段长度的多样性变化。2. Vδ2-CDR3的PCR产物纯化后连接PMD18-T载体重组质粒,转化及阳性筛选后用菌落PCR法对重组阳性质粒进行鉴定,并对阳性质粒PCR产物进行基因扫描分析确定其CDR3长度;3.对Vδ2-CDR3的PCR产物基因扫描优势峰对应的大部分重组质粒转化阳性克隆,以及部分非优势峰对应克隆的CDR3基因片段,测定DNA序列,并分析和比较其编码氨基酸的特征。4.从TB患者新鲜PBMC和正常人PBMC经Mtb耐热性抗原刺激增殖的T细胞扩增Vδ2-CDR3的最优势序列,合成多肽片段包被平板,加噬菌体7肽库温育后,先洗去未结合的噬菌体,然后洗脱并收获特异结合的噬菌体扩增。经3-4轮结合-淘选-扩增循环,富集特异性结合噬菌体,并经过DNA测序分析和ELISA验证阳性噬菌体,通过BLAST生物信息学分析和比对噬菌体展示多肽序列与Mtb抗原的相关性。5.从特异性富集噬菌体的多肽序列中寻找到的与Mtb相关的肽表位序列,合成7肽片段后作为抗原刺激正常人和TB患者的外周血PBMC,用流式细胞术检测γδ T细胞的增殖活性。结果:1对PBMC中TCRγδ的Vδ2-CDR3片段基因扫描结果显示:TB患者组(n=27)优势峰占总峰的比率(0.2755±0.0619)较正常人组(n=25)(0.1979±0.0346)高,TB患者组的长度变化范围为(25.11±5.52)较正常人为(19.87±3.52)高,差异均有统计学意义(p<0.0和p<0.0)。2TB患者TCRγδ的Vδ2-CDR3的片段数和最优势峰长度,与正常人比较无显著变化。3基因扫描分析显示CDR3转化阳性菌落PCR峰与CDR3的RT-PCR产物中的扫描峰有很好的对应关系;有意义的是最高频率菌落(占40%)的CDR3片段长度与PBMC的RT-PCR产物的基因扫描优势峰长度完全相同。4对CDR3转化的克隆(73个)的测序结果表明:TCR Vδ2–CDR3序列均由两端保守的侧翼序列和中间的多变序列组成;两端保守的侧翼序列由位于N端的“CACD”和位于C端的“KLIFGKG”组成,多变的中间序列97号位均含有疏水性氨基酸残基。该其中TB患者优势取用DJ3片段。每位TB患者有自己的优势序列,患者间偶发现有共有序列。5从TB患者新鲜PBMC中Vδ2-CDR3的优势序列挑选2个,和从正常人PBMC经Mtb耐热性抗原刺激增殖的T细胞中Vδ2-CDR3序列挑选2个,合成的4条多肽片段与噬菌体七肽库经4轮淘选后,得到特异性结合的噬菌体多肽序列47条,选择其中最富集序列和有交叉序列的9条,经GenBank BLAST比对分析,发现有4条7肽序列与某些Mtb抗原的序列高度重合。6从4条与Mtb抗原相关性的噬菌体多肽序列挑选2条合成7肽片段,用于体外培养实验发现,对某些正常人和TB患者个体的γδ T细胞有刺激增殖活性。结论:1. TB患者外周血γδ T细胞中Vδ2CDR3片段优势峰所占总峰比率比正常人的高,表明正常人γδ T细胞受体呈高斯分布,具有多克隆特点,而TB患者的显示寡克隆特点,提示TB患者的γδ T细胞经历了抗原特异性增殖。2TCRδ2基因CDR3片段中间的多变序列含有疏水性氨基酸残基,推测其与抗原肽结合的亲和力有关。TB患者大多优势取用DJ3片段,提示其与Mtb抗原的特异性识别可能有关。3.与健康人外周γδ T细胞经Mtb耐热抗原扩增后的Vδ2CDR3优势片段具有相同序列比较,TB患者的外周新鲜血γδ T细胞的Vδ2CDR3片段优势峰中序列呈多样化,提示不同TB患者的γδ T细胞的不同克隆参与对Mtb抗原的免疫应答。4本研究鉴定了4个TB患者特异性γδT细胞Vδ2-CDR3序列,经噬菌体七肽库筛选获得4条Mtb相关的抗原肽表位,并选择其中2条合成7肽片段,初步证实对正常人和TB患者的γδ T细胞有刺激增殖活性。
其他文献
产业投资基金是一种特殊投资基金 ,它以特定产业为投资对象 ,主要对特定产业的非上市企业进行股权投资。产业投资基金发展有利于我国经济金融体制改革 ,有利于产业结构调整和
以三氟乙酸为溶剂和催化剂,2,6-二氨基-3,5-二硝基吡嗪与过氧化氢反应制备了2,6-二氨基-3,5-二硝基吡嗪-1-氧化物(LLM-105),其结构经1H NMR,IR,MS,元素分析和四圆单晶X-射线
目的:建立并验证健康信念模式与计划行为理论的整合模型。方法:用北京城乡妇女铁强化酱油基线调查数据建立影响购买行为的通径模型,用追踪调查数据验证此模型。结果:价值观对
产业集群是当今常见的企业组合模式,而知识共享又是产业集群发展中需要面临的重要问题。文章以此为角度,在分析以往研究的基础上,将影响产业集群知识共享成熟度的因素分为主
铁基超导体具有高的超导转变温度、金属特性、比铜氧化物稍大的相干长度、较小的各向异性等,这些特点便于电流通过晶界,有利于材料的实用化。这就需要我们深入地研究铁基超导
<正>物品清点制度是手术室最基本最重要的规章制度,是杜绝物品遗留手术患者体内的保证。虽然各医院高度重视,但物品清点误差屡见不鲜,时有发生,是什么因素导致误差的发生,如
王尔德戏剧脍炙人口,充满妙语,其选词用句极考究,尤以人名意蕴让人玩味无穷,给人启迪。本文拟对其《名叫埃纳斯特的重要性》一剧中人名“埃纳斯特”和“邦伯里”的双关意蕴作一描
目的:本合成路线是以合成2-甲酰氨基噻唑-4-基乙酸为目的。方法:以2-氨基噻唑-4-基乙酸乙酯为起始原料,经取代、水解反应制得目标化合物。结果:该法简洁且原料价廉,总收率为72.3%。
对红曲霉、大曲以及根霉菌对单一酸(乙酸、己酸、乳酸、丁酸)和混合酸(四大酸按1:1:1:1混合)的酯化效果进行了研究,结果表明,红曲霉能促进己酸、丁酸及混合酸与乙醇的酯化作用,生成
改革开放以来中国社会经济的快速发展推动大量劳动力向城市聚集,使得城市住房、交通压力越来越大。越显紧张的用地推动了城市交通的多元化发展,地铁正是在这样的大环境下产生。