随着组织疆界日趋模糊，以合作代替竞争已经成为潮流，供应链成员间的合作显得日趋重要以往的文献中对于市场与层级组织之间的中间模式的探讨较少，而且有关分析比较企业在哪些情况下想要在合作关系当中投入股权来提高合作的紧密程度的文献也比较匮乏本研究的主要目的在于研究供应链成员选择不同合作模式的影响因素，并且探讨哪些因素对合作模式的选择有着关键影响能力本论文主要研究供应链中的制造商与供应商之间的合作关系，并以是否有股权投入作为切入点，将供应链合作模式区分为股权型合作模式和契约型合作模式应用交易成本理论，尝试提出影响供应链成员选择不同合作模式的因素主要来自于不确定性（包括需求不确定性技术不确定性以及绩效不确定性）专用性投资（包括供应商的专用性投资及买方的专用性投资），并根据文献分析探讨建立研究假设本研究以手机制造企业与纺织企业做为主要研究对象，重点研究制造商与供应商之间的合作模式采用问卷调查的方法收集初始资料并以因子分析提取主要因素，然后利用T检验及逐步判别等统计方法加以验证对手机制造业的实证研究发现：（1）所有的不确定性因素，以及供应商的专用性投资会显著影响手机制造企业是否会投入股权进而提高双方合作的紧密程度，而买方的专用性投资则不显著（2）对于区分两种合作模式，需求不确定性绩效不确定性技术不确定性有着较为重要的决定能力由研究结果发现不论不确定性是来自于产品需求不确定性合作产品技术不确定性或合作关系中公司绩效的不确定性都会显著影响手机制造企业是否投入股权，并且都具有比较关键的影响能力，不确定性是影响手机供应链合作模式选择的关键因素对纺织业的实证研究发现：（1）纺织产业中选择投入股权进行供应链合作的企业比例很小（2）影响企业是否会投入股权进而提高双方合作紧密程度的主要因素为需求不确定性与绩效不确定性，专用性投资并没有显著地影响企业的选择由手机制造业与纺织业的实证研究我们可以发现，交易成本对企业在进行供应链合作模式的选择时确实存在着影响，需求不确定性与绩效不确定性可作为区分两种合作模式的主要因素，而技术不确定性与专用性投资随着产业的不同对合作模式的选择的影响也会有不同本文理清了影响供应链成员选择不同合作模式的因素并且提出能够有效分类的关键因素，建立起由供应链延伸到决策面的延伸策略考量，为供应链成员进行供应链伙伴合作及投资提供了参考