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选取分离于不同地点、不同宿主的子实体或菌根的27株乳牛肝菌属真菌，使用ITS-RFLP和rDNA ITS序列分析对其进行分子鉴定和遗传多样性研究，并构建进化树对其系统发育进行探究。经序列比对分析，SP1、SP2、SP3、SP4、SP5、SP6、SP7、SP8、SP9、SF1、SF2、sF3、P.Lac-1、P.Lac-2、3′、3″、3＃属于褐环乳牛肝菌(Suillus. luteus)。根据序列相似系数将27株乳牛肝菌属真菌分为3个遗传类型。ITS-RFLP方法将27株乳牛肝菌属真菌分为两个酶切图谱，序列分析结果和酶切图谱基本吻合，樟Ⅱ和1″与其余菌株的遗传距离较大，其原因可能是宿主和生境的影响。序列分析方法能够更准确地分析出遗传差异，但ITS-RFLP方法更简单、实用，可以用于初步的菌株鉴定。两种方法结合可以更有效和准确的研究外生菌根真菌的分子鉴定和遗传多样性。