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目的通过二代高通量基因测序(next generation sequencing,NGS)技术,探讨羊水细胞中胎儿染色体拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)联合染色体核型分析技术在产前诊断中的应用价值。方法回顾性分析2016年01月-2019年06月在枣庄市妇幼保健院行产前诊断的单胎孕妇1206例。对具有产前诊断指征的孕妇行羊水穿刺术抽取羊水,通过二代高通量基因测序(NGS)技术对羊水细胞中胎儿染色体拷贝数变异测序(CNV-seq)并同时进行细胞遗传学-染色体G显带核型分析,将两种技术检出胎儿染色体异常结果分成两组,对两组结果进行比较分析,并随访其妊娠结局。结果1.1206例入组样本CNV-seq检测成功率100%,细胞遗传学-染色体G显带核型分析成功率为99.75%(1203/1206)。2.染色体核型分析共检出胎儿染色体正常81.18%(979/1206),胎儿染色体异常阳性率18.57%(224/1206),其中染色体数目异常阳性率11.61%(140/1206)包括常染色体数目异常阳性率9.04%(109/1206)、性染色体异常阳性率1.82%(22/1206)、嵌合体阳性率0.75%(9/1206);染色体结构异常阳性率6.96%(84/1206)其中包括染色体微缺失/微重复阳性率0.91%(11/1206)、平衡易位阳性率1.33%(16/1206)、倒位阳性率0.33%(4/1206)、染色体多态性阳性率4.39%(53/1206)。3.CNV-seq共检出胎儿染色体正常74.88%(903/1206),胎儿染色体异常阳性率25.12%(303/1206),其中染色体数目异常阳性率11.69%(141/1206)包括常染色体数目异常阳性率9.12%(110/1206)、性染色体数目异常阳性率1.82%(22/1206)、嵌合体阳性率0.75%(9/1206);染色体微结构异常13.43%(162/1206)包括致病性CNVs阳性率2.65%(32/1206)、致病性未知CNVs阳性率4.98%(60/1206);非致病性CNVs阳性率5.80%(70/1206)。4.CNV-seq与染色体核型分析结果相比,CNV-seq检出染色体异常阳性率、致病性CNVs阳性率、致病性未知CNVs阳性率高于染色体核型检出阳性率,P均<0.05,差异均具有统计学意义;染色体数目异常阳性率、非致病性CNVs阳性率两组均无差异性,P均>0.05,无统计学意义。而染色体核型分析检出染色体平衡易位阳性率高于CNV-seq检出,P<0.05,差异具有统计学意义。5.入组孕妇的年龄统计,随着年龄的增长,胎儿染色体异常发生率呈正相关,相关系数r=0.46352。6.CNV-seq联合染色体核型分析组与单用其中一种技术组检出胎儿染色体异常率相比较,差异有统计学意义,P均<0.05。结论1.CNV-seq对染色体核型分析发现的染色体非整倍体异常、非平衡性染色体结构异常检出一致。2.CNV-seq能检出更多的致病性明确CNVs,但检不出平衡易位、倒位染色体结构异常,因此CNV-seq不可取代染色体核型分析。3.随着孕妇年龄的增长,胎儿染色体异常检出率增高,因此高龄孕妇更适合行CNV-seq联合染色体核型分析进行产前诊断。4.CNV-seq联合染色体核型分析进行产前诊断,可以全面、有效的检测胎儿染色体异常,具有较高的临床应用价值。