温州地区原发性高血压与线粒体ND1基因变异的相关性研究

来源 :温州医学院 温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chengchao5618
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目的:   1.收集温州地区原发性高血压患者(Essential Hypertension,EH)的临床资料,采集其外周血,建立原发性高血压临床资料和线粒体基因组遗传学数据库。   2.开展原发性高血压患者的线粒体ND1基因变异筛查,绘制该基因突变频谱。   3.分析线粒体ND1基因变异与原发性高血压发生发展的相关性。   方法:   1.根据2010年《中国高血压防治指南》诊断标准,选取温州地区汉族人群中无血缘关系的1804例原发性高血压患者为实验组和512例健康人群为对照组,共2316例,收集其临床资料和外周血标本。   2.提取2316例临床受试对象的外周血全基因组DNA。   3.采用聚合酶链式方法(Polymerase Chain Reaction,PCR)特异性扩增线粒体ND1基因,琼脂糖凝胶电泳检测,直接DNA测序并分析。   4.应用生物信息软件(Codoncode aligner、Chromas、DNAstar)将测序结果与剑桥参考序列(revised Cambridge Reference Sequence,rCRS)比对,分析线粒体ND1基因变异位点。   5.借助Clustal X软件和相关蛋白质数据库,分析线粒体ND1基因的变异位点保守性,氨基酸变异情况,SOSUI在线软件分析蛋白质二级结构改变,并统计学方法分析线粒体ND1变异与原发性高血压的相关性。   6.绘制温州地区原发性高血压患者线粒体ND1基因突变频谱。   结果:   1.实验组与对照组临床资料对比,两组之间性别无显著性差异(P值=0.338>0.05);两组年龄在30-60岁之间占50%。   2.PCR扩增1804例实验组和512例对照组的线粒体ND1基因,测序后分析得实验组有1031例样本携带线粒体ND1变异,对照组有269例样本携带线粒体ND1变异;两组间样本携带ND1变异无显著差异(P值=0.064>0.05)。   3.实验组筛查线粒体ND1基因共有127处变异,其中基因变异频率为13.39×10-2/bp;对照组共有77处变异,基因变异频率为8.05×10-2/bp。两组间共同筛查得到变异位点共59处,且实验组基因变异频率高于对照组。   4.实验组ND1基因变异位点中有44处错义突变,83处同义突变;对照组则有31处错义突变,46处同义突变。   5.实验组的ND1基因变异累计总次数达1473次,错义突变累计总次数达444次,同义突变累计总次数达1029次;对照组的ND1基因变异累计总次数达439次,错义突变累计总次数达次123次,同义突变累计总次数达316。两组间无统计学差异(P值=0.405),但实验组错义突变累计次数所占总次数的比例高于对照组。   6.实验组中错义突变位点的种系发生分析,保守性分析≥75%共有23处,累计变异次数达128次;对照组变异位点保守性分析≥75%有11处,累计变异次数达22次;两组间存在差异,具有统计学意义(P值=0.05)。   7.蛋白质二级结构预测,T4216C,T4226C,A4231G变异使得ND1亚基二级结构发生改变,由8个跨膜区变为7个跨膜区。   8.PolyPhen-2蛋白功能预测软件检测结果显示T3308C、C3364A、G3391A、T3394C、A3593G、T3614A、T3644C、C3746T、A3796G、A4136G变异均对ND1亚基造成功能性的损害。   结论:   1.2316例临床受试样本中检测出了大量的基因变异位点,大部分可能是线粒体DNA的多态性位点,但是部分位点可能提高了原发性高血压发生的易感性。   2.线粒体ND1基因高度保守位点的变异位点,可能引起线粒体呼吸功能缺陷,导致氧化应激作用,参与疾病发生过程。  
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