【摘 要】
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帕金森病(PD)是最常见的与年龄相关性神经退行性疾病之一,其发病机制主要与黑质多巴胺(DA)的缺失有关。单胺氧化酶B(MAO-B)主要存在于大脑的胶质细胞中,其抑制可导致患者DA水平升高。MAO-B抑制剂已广泛应用于PD患者。然而,对MAO的非选择性不可逆抑制可导致酪胺的积累,并与食用富含酪胺的食物引发的严重高血压危机“奶酪效应”有关。本课题组,之前设计了一种计算策略来快速发现选择性MAO-B抑制
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帕金森病(PD)是最常见的与年龄相关性神经退行性疾病之一,其发病机制主要与黑质多巴胺(DA)的缺失有关。单胺氧化酶B(MAO-B)主要存在于大脑的胶质细胞中,其抑制可导致患者DA水平升高。MAO-B抑制剂已广泛应用于PD患者。然而,对MAO的非选择性不可逆抑制可导致酪胺的积累,并与食用富含酪胺的食物引发的严重高血压危机“奶酪效应”有关。本课题组,之前设计了一种计算策略来快速发现选择性MAO-B抑制剂(S)-1-(4-(3-氟苯氧基)苄基)氮杂环丁烷-2-甲酰胺(C3)。体外生物学评价结果表明,C3分子比沙芬酰胺具有更强的选择性,是一种很有希望调节MAO-B蛋白的药物。因此,本研究利用AILDE(An in silico ligand directing evolution)服务器衍生设计了一系列基于C3的衍生物。并分析了这些衍生物的结构与活性关系,其MAO-B受体蛋白的结合模式,以及对这些衍生物类药性及药代动力学进行计算。另外,在调查类药性预测工具的过程中,本研究发现许多类农药性分析方法已被开发用于筛选潜在的新型先导化合物。然而,目前还缺乏用户友好的、综合的评价类除草剂性的工具。我们通过对现有的商品化除草剂理化性质进行分析,得到一个定性规则和三个定量评分函数来评价化合物的类除草性,并将评分模型构建成是一个免费的网络平台Herbi PAD。它包含542种已上市的除草剂及其29000多个理化描述符,模型区分已知除草剂和非除草剂的准确性为84.2%。网站可通过以下地址访问:http://agroda.gzu.edu.cn:9999/ccb/database/Herbi PAD/。总之,利用AILDE取代基优化法对MAO-B抑制剂C3分子的衍生设计,将有可能找到活性优于C3分子的新分子。我们开发的类除草剂性评估工具Herbi PAD能够综合分析任意小分子成为除草剂的可能性,能够帮助除草剂研究者进行类除草活性的筛选,降低研发风险,提高研发效率。
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