研发活动对企业及国家产生的绩效及其对经济发展的贡献日益受到各界人士的关注，由于受到我国上市公司数据披露和获取的局限，以前学者大多数都集中在宏观和中观的层面对研发投入绩效进行研究，仅有少数学者尝试通过报表中归纳总结的研发费用支出从微观层面对企业进行研发投入绩效分析，其选取的研发数据主观性强，统计口径不一致可能导致结论的可信度较低。因此有必要从微观角度采用口径统一的研发活动数据对其绩效影响进行深入的研究，本文将从投入和产出的角度同时分析研发投入和专利产出对企业绩效的影响关系。本文选取我国中小企业板中的169家上市公司为研究对象，收集2006年至2010年样本公司的面板数据，先利用简单相关系数分析法将研发投入及专利授权数对企业绩效影响的滞后期进行研究，得出中小企业研发投入对企业绩效滞后三期和专利授权数对企业绩效无滞后现象的结论；随后将研发投入、专利授权数据作为解释变量，两个绩效指标总资产净利润率(ROA)和每股收益(EPS)作为被解释变量，企业规模、资产负债率、行业和滞后一年的企业绩效指标作为控制变量，建立多元线性回归模型对中小企业研发投入、专利授权数与其绩效的相关关系进行实证分析，通过面板随机效应的多元回归得到以下结论：（1）我国中小企业板上市公司滞后三年的研发投入与企业当年绩效无显著相关性；而且研发投入对企业不同绩效指标的贡献程度不一致。面板分析得出结论，虽然研发投入与绩效无显著相关性，但从回归系数来看，样本企业滞后三年的研发投入对企业ROA的影响程度明显小于其对企业EPS的影响。（2）我国中小企业板上市公司专利授权总数与绩效无显著相关性。（3）不同质量的专利对我国中小企业板上市公司的不同绩效指标呈现出不同的相关性；发明专利能有效提高企业EPS。实证结果认为不同质量的专利与企业ROA无显著相关性；而对于企业EPS来说，不同质量的专利却呈现出不同的相关性，即发明专利与企业EPS显著正相关，实用新型和外观设计专利并未对企业EPS表现出显著相关性。