【摘 要】
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根据P.aureofaciens 30-84的phzF 基因及P.fluorescens2-79的phzC基因最为保守的区域设计引物,以该PCR产物为探针筛库,选出阳性克隆后排酶谱、Southern杂交确定大片段进行sho
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根据P.aureofaciens 30-84的phzF 基因及P.fluorescens2-79的phzC基因最为保守的区域设计引物,以该PCR产物为探针筛库,选出阳性克隆后排酶谱、Southern杂交确定大片段进行shot-gun测序.结果表明送测DNA大片段含有8个完整的开放阅读框架命名为phzX1234567,其推测氨基酸序列与P.aeruginosa PAO1的吩嗪生物合成基因簇推测氨基酸序列完全一致,这一结果进一步证实了先前有关PCA生物合成基因簇的报道,即在假单胞菌属中吩嗪合成的核心基因簇是相当的保守的.酶谱和杂交实验发现在M18菌株中存在有两个拷贝的吩嗪生物合成基因簇.根据突变实验结果推测这两个拷贝在表达程度上存在差异.引物根据P. fluorescens Pf5的pltC 基因设计,之后所用方法与上段采用方法完全相同.送测DNA大片断包含有11个完整的开放阅读框架,命名为pltYX12345678Z,其推测氨基酸序列与P.fluorescens Pf-5的Plt生物合成基因簇推测氨基酸序列有一定程度的同源性.在M18菌株的Plt生物合成基因簇的下游发现存在一个调控基因,命名为pltZ.pltZ基因推测产物与P.fluorescens CHAO 中PhlH调控蛋白的氨基酸序列具有40﹪的相同,其具体功能尚在研究之中.
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