随着中国市场经济的逐渐发展和完善，越来越多的公司开始注意到了R&D投入的重要性，开始加大R&D投入的强度。但有关R&D的研究因为其数据的不易获得性而没有的到广泛的开展，并且创业企业该方面数据更不易获得，从而导致了有关公司治理结构对创业企业R&D投入强度影响的研究更加匮乏，而本文的研究重点就是探讨在创业企业中两者之间的关系。　　基于以上思路，本文选取了2006-2010年中小板和创业板上市公司中的创业企业为研究样本，主要运用代理理论(agency theory)，从风险行为的角度来剖析创业企业中公司治理结构和R&D支出之间的相关关系。　　实证研究发现:第一、管理层持股对创业企业的R&D投入有可能是促进作用也有可能是抑制作用，具体哪种作用要视企业处的具体环境而定，当第一大股东持股比例较高时，提高创业企业的管理层持股比例，可以促进该企业的R&D投入;当第一大股东持股比例较低时，提高创业企业的管理层持股比例，反而有可能会抑制该企业的R&D投入。第二、对于创业企业的个股回报率波动性对R&D投入的影响，本文得出的结论是当个股回报率波动性较高时，提高创业企业的管理层持股比例，可以促进该企业的R&D投入;当个股回报率波动性较低时，提高创业企业的管理层持股比例，反而有可能会抑制该企业的R&D投入。第三、如果依据持股时间和投资动机的不同将机构投资者分为两类:风险资本投资公司(VC)和以银行和证券基金为主的机构投资者（institution），实证研究发现风险资本投资公司(VC)的持股比例对创业企业R&D投入强度存在一种正向影响。