排污收费制度是我国一项基本的环境管理制度,它在促进经济效益、社会效益和环境效益的统一方面发挥着重要作用。这项制度一方面发挥着经济杠杆的作用,刺激排污者改进经营管理,治理污染,减少排放量；另一方面,还能够筹集环保资金用于污染治理或配备环保设施,控制环境恶化,达到保护环境的目的。本文以环境经济学理论为基础,运用比较分析、系统分析、实证分析等研究方法,借鉴国外排污收费制度的实行经验,研究我国现行排污收费制度的实施情况,目的在于找出这项制度的不足,进而提出完善我国排污收费制度的新思路和建议。首先从排污收费制度的起源说起,分析了环境资源价值理论、外部不经济性理论和污染损害补偿理论等环境经济学理论,探究了国外排污收费制度的执行情况；其次,回顾我国排污收费制度的形成历程,解读我国排污收费制度的法律依据、收费程序及收费标准情况,分析2003年一2007年排污收费、主要污染物排量及环保污染治理投资金额的发展趋势,得出排污收费制度在我国环境管理中发挥了作用,但在某些方面还存在弊端；再者,具体剖析我国现行的排污收费制度存在的问题,比如立法理念、收费标准等问题已经不适应当前社会经济的可持续发展；最后,针对发现的问题,提出修订环境法律法规及相关配套措施、调整排污收费标准、加强环境稽查力度、建立问责制度、公示制度、联动制约等多种制度,做好教育宣传工作的完善对策,并提出了逐步实行费税结合制度的建议。