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目的鼻咽癌(Nasopharyngeal Carcinoma,NPC)是我国头颈部恶性肿瘤之一,且具有较强的遗传易感性。本研究选择细胞周期依赖性激酶抑制基因(cyclin-dependent kinase inhibitor,CDKN2A),以及EB病毒感染时表达最广泛的BamH I A区右向转录物家族(BamH I A Rightward Transcripts, BARTs)主要成员之一A73基因为研究靶点,分别探讨CDKN2A以及EB病毒A73基因单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs)与云南鼻咽癌发病风险的关系。同时探讨各基因型与鼻咽癌临床参数之间的关系。方法随机抽取云南地区无血缘关系鼻咽癌患者95例和体检中心云南籍正常对照者100例,抽提外周血基因组DNA,应用TaqMan探针基因分型方法检测CDKN2A基因rs1412829多态性。采用巢式PCR法及测序方法,对51例云南籍鼻咽癌患者和52例云南籍健康对照进行EB病毒A73基因A157154C基因分型。结果1CDKN2A基因G等位基因在NPC组和对照(NC)组中的分布频率分别为20%和9%,两组间比较差异有显著性(P=0.023)。G等位基因携带者患NPC的风险为A等位基因携带者的2.497倍。(OR=2.497,95%CI=1.107~5.632,P=0.031)。2.NPC组与NC组CDKN2A基因的AA、AG及GG的基因型频率分布有显著统计学差异(P=0.031)。3.NPC组CDKN2A基因多态性与病理分期Ⅳ期间有相关性,即含有突变为G等位基因较易出现在病程晚期的NPC患者中,差异有显著统计学意义(P<0.001)。4.EB病毒基因A73基因A157154C C等位基因频率在NPC组为96.1%,明显高于对照组的51.9%(P<0.001);NPC组CC基因型频率(96.1%)显著高于对照组(42.3%),差异有显著性(P<0.001)。5.EB病毒A73基因C等位基因携带者患NPC的风险为A等位基因携带者的22.685倍,其相对危险度(OR)为22.685,95%CI=7.772~66.217,差异具有显著统计学意义(P<0.001)。6.NPC组男性患者EB病毒A73基因CC基因型频率显著高于女性患者(73.2%vs.26.8%),差异具有显著性(P<0.001)。结论CDKN2A基因A157154C基因多态性中G等位基因可能是NPC的危险因索。该基因多态性与病理分期间存在相关性。可以认为含有突变为G等位基因较易出现在NPC病情发展的晚期,即病程的Ⅳ期。EB病毒A73基因A157154C基因多态性中CC基因型可能是NPC的危险因素。该基因多态性与性别间存在相关性,在男性患者中CC基因型频率73.2%显著高于女性患者的频率26.8%,这或许是NPC发病率男性显著高于女性的原因之一。