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H9N2亚型禽流感1992年在中国首次发生,二十多年来,在我国各地多次发生,给家禽养殖业造成的损失惨重,如何防治H9N2亚型禽流感是我国兽医工作者始终在探索的问题。由于H9N2AIV的不断的突变和重组,我国现有的H9N2亚型禽流感疫苗效果时好时坏,另一方面,禽流感病毒不断跨越种间屏障,严重地威胁到人类的生命安全。持续不断地监测禽流感病毒的变异情况和禽流感抗体水平变化,有利于捕捉到新型的对人类生命安全构成威胁的毒株和其疫苗的研制,对人类公共卫生安全具有重大意义。为监测H9N2亚型禽流感病毒的分子演化和变异动向,2015年7月-2016年2月,选取江苏省南京、苏南、苏北等八个地区64个活禽市场及禽类养殖场,每月采集血清和拭子样品。采用血清学方法监测血清抗体水平的动态变化。分离并初步鉴定H9N2亚型禽流感病毒并测定阳性毒株的全基因组序列。采用DNAstars和Magalign生物软件分析基因序列及氨基酸变异情况,并用MEGA软件绘制遗传进化树。本研究共采集了血清样品2869份,拭子2966份。其中,鸡血清1933份,拭子1954份;鸭血清405份,拭子432份;鹅血清531份,拭子531份。本次H9N2禽流感抗体监测共检测了 2256份血清样品,其中,合格血清有1346份,总体合格率为59.66%,比农业部最低标准低10.34%,离散度较大;血清抗体效价为0的有479份,占检测样品的21.23%。不同家禽品种的抗体监测结果显示,鸡的抗体合格率>鹅的抗体合格率>鸭的抗体合格率,分别为71.28%、57.75%和10.68%。不同地区血清样品合格率总趋势为苏南>南京周边>苏北,分别是64.87%、58.33%和50.22%,分别比最低标准低5.13%、11.67%和19.78%。监测结果显示,抗体水平随时间变化波动较大,抗体水平最高的是2016年2月份,为71.31%,最低的是2015年7月份,为47.18%。不同养殖规模抗体监测结果显示,抗体水平合格率的总趋势为种禽场>规模养殖场>活禽市场>散养户,可见,种禽场和规模养殖场免疫程序执行严格,有助于防止禽流感发生;活禽市场和散养户家禽抗体合格率分别为46.84%和16.07%,存在较大安全隐患。本研究共分离出3株H9N2亚型禽流感病毒,测定了其全基因组序列,对基因序列和氨基酸序列同源性分析结果表明:3株病毒均具有低致病性禽流感病毒的显著特征,其HA基因均属于Y280亚系BJ/1/94分支,NA基因均属于SH/F/98亚系,NP、NS、PB1均来自SH/F/98亚系,而MP、PA、PB2基因属于G1亚系。3株病毒的基因遗传进化分析表明,除PB2基因发生突变产生了新的基因型外,均未发现其他基因差异性突变;H9N2亚型禽流感病毒的进化与时间有关,而与地理位置分布无关。