自2018年起,我国开始进入大规模减税降费、促进实体经济发展、支持科技创新的新阶段。增值税作为第一大税种,适当降低税率、统一小规模纳税人标准、增值税留抵退税三项改革成为减税降费舞台上的“重头戏”。其中,增值税留抵退税政策作为三项改革之一,越来越受到各方面的关注。2011年,国家为鼓励集成电路发展,对国家批准的29家研究集成电路重大项目的有关企业购进设备形成的留抵进项税额予以退还,增值税留抵退税初露端倪。2019年4月1日,我国开始对全行业按比例退还新增留抵税额,增值税留抵退税政策正式拉开了帷幕。实践表明,留抵退税政策已经在促进企业创新、增加企业现金流、激发微观主体活力等方面起到了较大的促进作用,并在此基础上增加了各级政府的税收收入,带动了国家经济的高质量发展。因此,系统分析增值税留抵退税政策的相关理论与发展沿革,在优化增值税留抵退税政策过程中综合考虑其政策效应与央地政府财政负担,有助于留抵退税政策顺利实施,也有利于降低改革的成本与复杂性,减少改革的阻力。在框架结构上,本文按照提出问题一—基本概念与理论分析——分析问题——解决问题的思路对留抵退税政策进行研究。本文主要分为六章:第一章为导论。该部分阐述了本文的研究背景与研究意义,梳理了国内外学者对税收优惠、增值税留抵退税政策的相关研究,总结了已有文献的研究结论,构建了本文的研究框架,列举了本文的研究方法,分析了本文的创新点与不足之处。第二章为概念界定与理论基础。本部分阐述了增值税留抵退税、留抵退税央地财政负担的基本含义,分析了留抵税额的形成原因,揭示了央地财政负担的确定原则,介绍了本文的理论基础。第三章为增值税留抵退税与央地财政负担的现状分析与内在逻辑。本部分主要梳理了增值税留抵退税政策与央地财政负担的相关规定,使用相关的数据、新闻报道等资料剖析了政策现状,并在此基础之上,对增值税留抵退税的政策效应与央地财政负担内在逻辑进行了简要论述。第四章为企业创新视角下增值税留抵退税政策效应分析。本部分主要以企业创新为视角,通过实证研究分析了增值税留抵税额的存在是否能够抑制企业研发投入;对哪些行业研发投入的抑制效果较大;抑制企业研发投入的中介机制是什么;留抵税额的存在对企业其他方面是否存在一定的影响。实证研究结果表明:增值税留抵税额的存在确实会抑制企业新技术、新产品、新工艺研发投入,并且对先进制造业、研发投入积极性高的企业、有限责任公司、私营企业、大型企业的抑制效应更大且更为显著,中介机制分析结果也证实了留抵税额的存在确实会减少企业的经营性现金流,抑制企业的创新与发展,此外通过进一步基准回归分析证明了留抵退税政策最终会增加政府的税收收入。第五章为增值税留抵退税央地财政负担的规模测度与机制设计。第一,本部分使用相关数据,按照现行增值税留抵退税负担机制的相关文件与各级政府的有关部署,大致预测了我国中央政府、地方政府所需要承担的留抵退税规模;第二,本章选取几个典型企业所在市级政府进行对比分析,发现我国现行增值税留抵退税负担机制中仍然存在权责不对等的问题;第三,本章以典型市级政府为例,探究了《国务院关于印发实施更大规模减税降费后调整中央与地方收入划分改革推进方案的通知》（国发[2019]21号）实施前后地方政府退税压力的变化,对比分析了现行增值税留抵退税地方政府财政负担对高财政收入地区与低财政收入地区的异质性影响,提出了基于实证分析的完善增值税留抵退税央地财政负担机制的方案。第六章为完善增值税留抵退税及央地财政负担机制的政策建议。本章主要结合前文的理论分析与实证研究,对进一步完善增值税留抵退税政策提出了对策建议,主要包括以下三点:一是完善增值税留抵退税央地财政负担机制;二是加大增值税留抵退税政策对企业的扶持力度,降低企业享受留抵退税政策门槛;三是加大中央政府对各级政府与各企业的监管力度。本文通过实证分析与规范分析相结合的方式,深入剖析了增值税留抵退税的政策效应与负担机制,为进一步完善我国增值税留抵退税政策、落实减税降费、激发企业活力、提高政府税收收入、带动经济高质量发展提供了理论与实践层面的支撑。