自20世纪90年代我国开始逐步引入独立董事制度，该制度是建立科学的治理结构、避免内部人控制、保护中小股东利益的有效手段。由于独立董事引入我国的历史背景和目的不同于西方国家，所以独立董事制度在中国的发展和运作有其特殊性。当前，我国上市公司内部人控制下的“一股独大”的现象和由此引发的大股东不当窃取国家和中小股东利益的现象较普遍，如何合理借鉴国外独立董事制度先进的理论和实践经验来完善我国的独立董事制度是一个极富实际意义的课题。在我国现阶段独立董事制度是否和如何有效的完成它的使命?这是本文要关注和解决的问题。 本文首先从独立董事的概念入手，阐述了独立董事制度在西方的起源和引入我国的历史背景。并以会计视角从委托代理关系，代理人与委托人的效用函数，公司运行成本及独立董事在公司治理中的重要地位几个不同的角度在理论上论证独立董事制度建立形成的必要性。其次，分析我国现阶段独立董事制度有效性，其中利用我国从2000年设立独立董事的上市公司的违规行为和经营业绩进行实证分析，研究结果表明由于受诸多主观、客观因素的影响，现阶段我国独立董事制度并未对公司业绩的增长和中小股东利益的保护起到显著效果。接着，从我国特有的制度环境出发，结合新制度经济学的理论，通过对外部公司治理机制，内部公司治理机制和独立董事制度本身的探讨对我国独立董事制度的现状进行成因分析。最后，本文借鉴国外独立董事制度的实践，结合目前我国独立董事制度存在的问题，提出了完善我国独立董事制度的可行化建议，包括设立独立董事协会；采用累计投票制完善独立董事的选聘机制；建立薪酬激励配合股票期权的激励机制；培育和建立独立董事人才市场；建立独立董事业绩评估指标体系等建议。此外，本文还就独立董事和监事会的关系问题作了进一步的探讨，明确独立董事与监事会的功能定位，使独立董事与监事会相互协作，共同发挥监督作用。 因此，对于独立董事制度与公司治理结构的研究，可以帮助我们认清现行独立董事制度在我国是否有效的运行，同时借鉴西方的经验并结合我国的实际情况对独立董事制度不断完善以切实保护中小股东的利益，这一问题的解决必将有利于我国证券市场公正性的提高，有利于公司尤其是上市公司治理结构的改善，有利于加强公众对中国证券市场的信心。