近年来,随着供给侧改革逐步深化,国内宏观经济发展从高速增长阶段转入质量型增长阶段。在“中国制造2025”的号召之下,不少处于价值链低端、经济创造效益低下的传统企业,不断加大研发投入和并购力度,撕去劳动力密集型或资本密集型行业的标签,转型进入技术密集型行业,升级成高价值创造的创新型企业。企业转型升级的过程需要大量的资金和资源来积极运营新项目、提升生产技术、开展组织变革以应对快速变化的内外部环境。然其投入的高额成本却未必能百分之百地转为高收益,因而传统企业在转型升级期面临着高风险。传统的企业价值评估方法虽能反映该类企业的基础价值,但忽略了企业在应对投资项目的高度风险时,能通过灵活做出决策,及时止损、扩大收益的价值。因此,转型升级企业该采用何种价值评估方法成为了值得研究的问题。本文首先梳理了企业价值评估方法和二叉树期权定价模型的概念以及运用领域,为下文设计转型升级企业价值评估方法奠定理论基础。其次,本文分析了我国现阶段转型升级企业的价值特征,指出了目前转型升级企业所采用的价值评估方法中存在的问题,提出用实物期权来弥补这些方法的不足,进而提出了基于二叉树期权定价模型的转型升级企业价值评估思路（转型升级企业整体价值包含基础价值与潜在价值两个部分）,设计出转型升级企业价值评估模型（转型升级企业的基础价值评估用自由现金流量折现模型评估,潜在价值用二叉树期权定价模型评估）。再次,本文以转型升级中的N公司为例,将其企业价值分为基础价值和潜在价值,详尽地展示了基于二叉树模型的转型升级企业价值评估模型的运用过程。本文选取了N公司2019年12月最后20日的平均收盘价作为其企业价值标准,与按照本文计算出的N公司的企业价值相比较,若两者相差无几,则说明基于二叉树模型的价值评估方法的能精准地评估出传统企业在转型升级期的价值。最后,本文得出以下结论:（1）处于转型升级期的传统企业面临着高度不确定性,使其大量投资项目中蕴藏着的柔性投资决策权具有价值,因而其企业价值应分为基础价值和潜在价值两部分;（2）自由现金流量折现模型从企业整体出发,以现金流入而非会计利润作为评价企业收益的指标,解决了转型升级期企业费用和会计收益不匹配的问题,能衡量出转型升级企业所有表内以及智力资本、社会资本等表外无形资产现阶段所创造的价值,因而可以用来评估转型升级企业的基础价值;（3）在实物期权法下,转型升级企业拥有的潜在价值（即柔性投资决策权价值）可以被量化为延迟投资、放弃投资、追加投资等期权的价值,并且运用二叉树期权定价模型能精准地评估出转型升级企业的潜在价值。