【摘 要】
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猫传染性腹膜炎病毒(Feline infectious peritonitis virus,FIPV)属于猫冠状病毒科猫冠状病毒属(Feline coronavirus,FCo V)的一类RNA病毒。FCo V包括猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)和猫肠道冠状病毒(FECV)两种生物型。目前,对于FIPV,我国的流行病学研究较少,对于FIPV尚无有效疫苗,缺乏有效的检测方法,严重影响者猫科动物的健康。
【基金项目】
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云南省科技厅重点研发计划项目(项目编号:2018BB004); 云南省科技厅科技人才和平台计划项目院士专家工作站(项目编号:2019IC062);
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猫传染性腹膜炎病毒(Feline infectious peritonitis virus,FIPV)属于猫冠状病毒科猫冠状病毒属(Feline coronavirus,FCo V)的一类RNA病毒。FCo V包括猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)和猫肠道冠状病毒(FECV)两种生物型。目前,对于FIPV,我国的流行病学研究较少,对于FIPV尚无有效疫苗,缺乏有效的检测方法,严重影响者猫科动物的健康。为此,本研究建立两种PCR检测方法,并结合测序分析技术,可进一步提高猫传染性腹膜炎病毒的检测精准性,为此病的防治提供科学的依据。本论文的研究内容包括以下三个方面:(1)猫传染性腹膜炎病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法建立旨在建立检测FIPV的实时荧光定量RT-PCR方法,通过对GenBank中FIPV N基因序列比对,选取N基因为靶基因,利用生物学信息软件,通过对N基因的序列分析,并针对N基因的保守区域设计特异性引物及TaqMan探针,建立以N基因为检测基因的实时荧光定量RT-PCR方法,检验方法的特异性、灵敏度和稳定性。标准曲线方程为y=38.445-3.3083x,可信度(R~2)为0.9989,扩增效率(E)为100.5%,最低检测限为3.4×10~1copies/μL,重复性变异系数(CV)不超过5%。利用建立的荧光定量PCR方法检测FIPV、狂犬病毒(RV)、猫疱疹病毒(FHV)、猫杯状病毒(FCV)、猫细小病毒(FPV)、犬流感病毒(CIV)、犬瘟热病毒(CDV),无交叉反应,具有良好特异性。此方法无法区分猫传染性腹膜炎病毒与猫肠道冠状病毒。建立的猫传染性腹膜炎病毒实时荧光定量PCR方法具有灵敏性高、重复性好、特异性强等特点,可用于猫传染性腹膜炎病毒的的快速诊断和检测。(2)猫传染性腹膜炎病毒RT-PCR检测方法建立针对FIPV的M基因设计一对特异性引物,目的片段大小为522bp。优化了RT-PCR的退火温度,并进行了特异性试验和灵敏度试验,FIPV的最佳退火温度为53℃,且与其他病毒无交叉反应,包括狂犬病毒(RV),猫疱疹病毒(FHV),杯状病毒(FCV),猫细小病毒(FPV),犬流感病毒(CIV),犬瘟热病毒(CDV)证明该RT-PCR检测方法特异性良好,FIPV的最低检测量分别为1.9x10~4copies/μL,结合扩增产物基因测序,可有效区分猫肠道冠状病毒,提高检测方法的精准性。(3)猫传染性腹膜炎病毒实时荧光定量RT-PCR试剂盒试制试制FIPV实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒。采用双层纸板包装,制成猫试剂盒的外包装,再根据核心试剂的大小以及样品数量的多少,设计FIPV实时荧光定量RT-PCR试剂盒的大小。FIPV实时荧光定量RT-PCR试剂盒内包括检测的核心试剂、阳性对照DNA,阴性对照DNA和无菌水。试剂盒内含有25个PCR反应管及操作步骤说明书一份。按照25μL体系将稀释好的引物与2 x PCR Mix及dd H2O混合,参照说明书进行试验。试制试剂盒取3批次进行批内、批间重复性试验,Ct值变异系数均低于5%,具有良好的重复性。试剂盒放置于-20℃保存,分别取0、1个月、2个月、3个月、4个月、5个月、6个月、7个月的试剂盒对4个阳性株模板、2个阴性模板及空白对照进行检测,3批次试剂盒检测结果符合要求。
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