信息技术的飞速发展，加快了医疗卫生体系现代化、信息化的进程。大量信息系统运行在各类各级医疗卫生系统平台上。因此，如何保证这些信息系统的正常运行和数据信息的安全就成为医疗卫生系统极为重视的问题。科学严密的安全保障体系能为信息系统提供一个安全有效的运行环境。容灾备份系统作为安全保障体系中的重要组成部分不可或缺。本文依托国家十一五重大专项课题“防治艾滋病规模化现场流行病学和干预研究”的子课题“基线调查与信息综合管理系统”的容灾备份系统的分析设计和实现展开。首先介绍了容灾备份基本概念、关键技术和策略、容灾备份系统的实现方式、重复数据删除技术和经典算法；然后，重点对“基线调查与信息综合管理系统”的容灾备份系统进行分析，综合应用当前成熟的容灾备份理论技术，提出了“‘三地两中心’+同城‘双机热备’”的容灾备份系统设计方案；同时在生产中心、同城备份中心、异地备份中心数据信息备份的过程中，提出并采用一种新的基于CDC算法改进的并行两轮远程文件同步算法PTCDC（Parallel Two-round CDC）来消除重复数据。最后，选取不同类型试验样本数据对并行两轮远程文件同步算法PTCDC的性能进行了测试，并对实验结果进行分析和评价，实验结果表明PTCDC在备份效率和传输速率上都优于CDC算法，能有效地减少网络中传输的数据量，进而降低带宽消耗和传输成本，节省存储空间，对系统的整体运行和有效备份起到了很好的效果。