志贺菌流行株Ⅰ类和Ⅱ类整合子的特征及与耐药性关系的研究

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liujia6949
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
近来的研究显示,革兰阴性菌中一种基因捕获和表达的遗传单位——整合子(integron)在细菌获得抗生素抗性机制中起了重要作用。整合子由整合酶(integrase)基因(intl)、整合酶特异性重组点attI和数目不定的基因盒(gene cassette)组成。基因盒往往由一个编码抗生素抗性的开放读码框(ORF)和一个整合位点attC组成。基因盒可从整合子中切除成为游离的环状分子,或者将外源基因盒捕获并整合入整合子。 近些年临床上分离的志贺菌对以往临床常用的抗生素逐渐耐药,有的菌株甚至多重耐药。以往研究表明,结合性质粒在志贺菌耐药性形成起了重要作用。新近数起研究报道了志贺菌中Ⅰ类和Ⅱ类整合子与菌株耐菌性关系。本研究对杭州地区近年分离的福氏和宋内氏志贺菌株进行Ⅰ类和Ⅱ类整合子的检测,了解其分布特征;进一步通过克隆测序和Southenblot,确定其携带的基因盒组成特征以及其在基因组中的位置;在研究中发现了一种缺少3’保守区的非典型Ⅰ类整合子,通过反转PCR了解此整合子的切除基因盒的特征;并对非典型Ⅰ类整合子和Ⅱ类整合子各自携带的aadA赋予宿主菌链霉素抗性的不同能力,进行了探讨。 本研究的64株宋内和福氏志贺菌中,63株分别于1998至2002年分离自杭州地区散发腹泻病人、暴发病人,1株分离自一起暴发事件的水源。 1.典型Ⅰ类整合子的分布及一级结构特征 典型的Ⅰ类整合子包括有5’保守片段(intI1)、可变基因盒区(引物inF~inB)和3’保守片段(引物qacEΔ1~sul1)。本文64株福氏和宋内志贺菌株中,三者均阳性 浙江大学博士学位论文的菌株仅有6株,阳性率为9.4%。对其可变区测序分析,其中2株宋内志贺菌I类整合子均携带1个基因盒,为氨基糖昔腺营酞基转移酶(aminoglycosideadenylyltransferase)AZ基因(aa朔2),编码对链霉素的抗性。另2株宋内志贺菌I类整合子携带2个基因盒,分别紧邻5’保守区依次为二氢叶酸还原酶(dihydrofolatereductase) Al型基因(咖月I)和氨基糖昔腺普酞基转移酶Ala基因是(a adAla),以及二氢叶酸还原酶A17型基因(动讨I乃和氨基糖昔腺昔酞基转移酶Ala基因(aa咖习。1株福氏志贺菌y变种携带的基因盒类型与其中一株宋内志贺菌相同,为护汉17和aad减万。1株福氏6型志贺菌携带一个dfrV基因盒。分别提取2株携带典型I类整合子的宋内志贺菌株基因组DNA和质粒DNA(其中基因组DNA经B“mHI和PstI限制酶切),琼脂糖凝胶电泳后,intll探针Southenblot结果显示典型整合子是位于质粒上的。 2.非典型I类整合子的分布及一级结构特征 在检测典型I类整合子过程中,发现了30株intll阳性,但可变区阴性、3’保守区阳性仅有3株(阳性率为5.1%),推测福氏志贺菌株中可能广泛存在着某种非典型I类整合子。选择此类菌株分别提取基因组DNA和质粒DNA(其中基因组DNA经BamHI和Pstl限制酶切),琼脂糖凝胶电泳后,intll探针SOuthenblot结果显示提示此intll是位于细菌染色体上的。将其中CIOI一1株基因组DNA中intll阳性的BamHI和Pstl限制酶切段(3 .4 kb)克隆至载体pUC19上(此质粒称为puc一C101),并进行核酸序列测定。序列分析表明此插入片段依次由intll基因、attl位点以及blaoxA30和aadAI基因盒组成,典型I类整合子3’保守区部分被一段插入序列151所替代。2个ORF分别编码p内酞胺酶OXA一30和氨基糖普腺昔酞基转移酶Al。 应用扩增此型基因盒区的引物intl Ica一F和引物15 Ica一R,对本文所有菌株进行PCR扩增,结果30株intll阳性的无典型I类整合子的志贺菌株中(1株宋内志贺菌,29株福氏志贺菌),29株扩增出相同长度的PCR产物,而6株携带典型I类整合子的志贺菌和其余28株intll阴性的志贺菌均未扩增出阳性条带(见表l)。结果表明,此29株intll阳性志贺菌株有着相同的基因盒区,我们将之称为志贺菌非典型I类整合子(intll和intH一151同时阳性);福氏志贺菌中此非典型I类整合子总 浙江大学博士学位论文检出率高达84.8%(28/33),尤其是福氏2a和2b中均为100%(13/13和9/9):宋内志贺菌中则较低,为3.2%(l/31)。非典型I类整合子阳性菌株中氨节青霉素抗性的阳性率分别为100%(21/2l),而其他非典型I类播合子阴性菌株中为51.9%(14/27)。 3.非典型I类整合子的基因盒切除模式 我们使用反转PcR在携有pUC一c101的大肠埃希菌过夜培养肉汤煮沸物中检测到了游离基因盒的存在,并发现了aadAI基因盒与blaoxA-30基因盒连锁的切除模式。结果表明,此非典型I类整合子是功能性的。 4.H类整合子分布及其一级结构特征 通过检测n类整合子intIZ基因,结果发现H类整合子在宋内和福氏志贺菌中分布广泛,阳性率分别达80.6%(25/31)和87.9%(29/33)。进一步研究表明11类整合子是位于染色体上的。 提取intIZ阳性的宋内志贺菌C202株的基因组DNA,将一条含intIZ的去斤”dm限制酶切段(10.7 kb)克隆至载体pUC19上(此
其他文献
当今社会,文化作为一种国家软实力和综合国力的体现,其地位和作用不言而喻,随着经济全球化的迅猛发展,各国之间的文化交流与冲突逐渐加深,国家文化安全问题日益凸显,已经成为国家安全中的重要内容。而大学生作为国家与社会的重点培养对象,是国家与民族的希望,其思想意识、道德品质以及行为举止等必须要满足国家发展的利益和人民幸福的需求。因此,当代大学生势必要维护国家文化安全,树立良好的文化安全意识,让中华优秀文化
文章利用1958—2019年安岳县气象资料,分析了安岳县不同季节干旱的特点、气候规律,进而探讨了其成因以及严重干旱年的循环特征,提出了防御或解决干旱的对策建议,以供参考。
空间关系是一种基本的存在关系。前置词是俄语中特有且十分重要的词类,而现代汉语介词作为虚词与俄语前置词有许多相似之处。汉语介词与俄语前置词,对于外语学习者来说都是难
文章根据创新创业教育模式下机械工程专业人才培养目标,提出了培养方案、课程体系等教学改革方案和措施,结合厦门工学院机械工程专业实际情况,进行教学改革尝试。
介绍了膜生物反应器的工艺组成和特点、膜分离膜生物反应器工艺类型、处理污水的优缺点,简明介绍了膜生物反应器在不同领域的应用。针对当前国际上应用最广的三种膜生物反应器
随着整个旅游市场的快速发展和体验经济风潮的快速到来,人们对旅游体验产品的情景互动、参与体验等方面的要求越来越高。旅游产品结构的升级换代势在必行。本文对二郎山景区进
在十八大提出"两个一百年"目标和习近平同志提出"四个全面"战略布局的今天,弘扬和培育民族精神至关重要,它是实现中华民族伟大复兴中国梦的题中应有之义。本文从培育和弘扬中
海南省食品、农产品出口日本正处于上升势头.但一个多月后,我省出口企业将面临日本对农产品药物残留更为严格的要求。
课外小实验作为课堂教学的延伸,应与科学学科教学相互补充相互促进。结合教学实际,论述了课外小实验设计的几个关键点,及在培养、提升学生科学素养的作用。 Extracurricular
结合现阶段地陪制服在旅游行业中的设计现状,着重分析了地陪制服设计中款式、面料与色彩等设计要点,对旅游行业地陪人员的制服设计具有一定的指导意义。