鼻咽癌基因差异表达及血清蛋白标志物的研究

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在世界上,鼻咽癌(nasopharynealcarcinoma,NPC)以中国南方的广东省最为高发,放射治疗是其首选的治疗方法,5年生存率在50%~60%之间。早期诊断是提高生存率的重要途径之一。因此,寻找早期诊断和病情监测的分子指标,对提高临床诊疗水平和生存率具有重要意义。   鼻咽癌发展至晚期呈现的上、下行型,具有显著不同的临床特征、治疗策略和预后转归。寻找它们之间的分子差异,对鼻咽癌的分子分型、预后预测具有实用价值,也为研究其发生发展规律奠定分子基础。   本课题的研究目的旨在寻找上、下行型鼻咽癌之间的差异表达基因以及血清差异蛋白质;寻找鼻咽癌的血清蛋白标志物。 研究方法与结果:1.利用oligo基因芯片检测技术,选用函盖2.3万条基因及EST的基因芯片,研究上、下行型鼻咽癌组织之间的基因表达差异。结果发现了17个差异表达基因,其中4个在上行型的表达高于在下行型的表达,13个在下行型的表达高于在上行型的表达,差异倍数在2.4~4.23倍之间。用半定量RT-PCR方法进行验证,初步明确DIO2基因在下行型鼻咽癌的表达高于在上行型的表达。2.利用国际上先进的、由蛋白质芯片和飞行质谱检测相结合的SELDF-TOF-MS系统技术,选用WCX2型蛋白芯片,检测鼻咽癌患者和正常人的血清蛋白质谱,采用CiphergenProteinChip3.0和Biomarkerwizard分析软件,研究它们的蛋白质谱差异。结果在鼻咽癌患者和正常人之间,筛选出17个差异蛋白质。其中5个差异非常显著,P值从3E-10至<0.0001,分子量分别为2819Da、4348Da、5479Da、8689Da和7954Da,可作为鼻咽癌候选标志蛋白进一步深入研究。采用BiomarkerPatternsTM分析软件,对鼻咽癌患者和正常人之间的差异蛋白质进行分析,建立2819Da和8689Da两个蛋白质的组合模型——区分鼻咽癌与正常人的“分类树”。用未知样本进行盲法验证该“分类树”,其诊断鼻咽癌的敏感度、特异度和阳性预测值分别为85%、84%和81%。3.利用SELDI-TOF-MS系统技术,选用WCX2型蛋白芯片,研究上、下行型鼻咽癌患者的血清蛋白质谱差异。结果在它们之间,发现8个差异蛋白质,其中2个在上行型的血清表达水平高于在下行型,6个在下行型的表达高于上行型。其中4115Da蛋白的血清表达水平在鼻咽癌患者高于正常人,在下行型鼻咽癌又高于上行型患者。8891Da蛋白的血清表达水平则在鼻咽癌患者低于正常人,在下行型鼻咽癌又低于上行型患者。三、 结论:1.上、下行型鼻咽癌组织之间存在基因的表达差异。2.鼻咽癌患者与正常人之间,血清蛋白质谱存在差异。利用SELDI-TOF-MS系统技术,发现了鼻咽癌相关蛋白和特异性较高的候选蛋白标志物。3.用血清差异蛋白质可建立区分鼻咽癌与正常人的蛋白质组合模式。4.上、下行型鼻咽癌患者血清之间,存在差异蛋白质群。
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