纤毛虫eRFl终止密码子识别特异性的功能结构域分析

来源 :山西大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Mr_Law
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
当mRNA上的终止密码子UAA,UAG或者UGA到达核糖体的A位点时,被肽链释放因子识别,蛋白质翻译终止。真核生物中,有两类肽链释放因子参与翻译终止过程,分别为eRF1和eRF3,但具体的机制尚不完全确定。大多数高等真核生物eRF1能识别三个终止密码子,而纤毛虫eRF1却只能识别三个终止密码子中的一个或两个,称为密码子识别特异性eRF1。研究显示第一类肽链释放因子的N结构域负责终止密码子的识别,其包含3个高度保守的模体结构域:GT区,TASNIKS区和YCF区,对eRF1识别终止密码子的活性有较大影响。纤毛虫eRF1识别终止密码子的特异性是否受到N端三个保守模体或其中关键氨基酸的调控,以及三个模体结构之间的关系是值得探讨的问题,结果有助于进一步阐明肽链释放因子识别终止密码子的分子机制。本实验首先构建了嗜热四膜虫(Tetrahymena) eRFlN端结构域与酵母的M、C端结构域组成的嵌合体eRFl(Tt/Sc eRFl)。利用双荧光素酶报告体系,在eRF1基因敲除的酵母细胞株中测定嵌合体Tt/Sc eRFl识别终止密码子的性质和活性,结果显示,Tt/Sc eRFl对终止密码的识别具有一定的特异性,即对UAA和UAG的通读效率明显高于UGA,与四膜虫eRF1的性质一致(对UGA、UAG、UAA的通读效率分别为2.49%、4.07%、10.12%)。为了分析eRF1中影响终止密码子识别性质的关键模体和氨基酸,我们通过定点突变的方法将嵌合体Tt/Sc eRFl的N结构域中保守模体的一些关键氨基酸,突变为酵母eRF1相应的氨基酸。结果显示,TASNIKS模体内的突变K57T/T59S/D63S使嵌合体eRF1对UGA.UAG通读效率比野生型分别提高了13.45%、1.84%,对UAA的通读效率降低了3.48%;YCF模体内的突变F125L/S128N使嵌合体eRF1对UGA的通读效率提高了3.04%,对UAG、UAA通读的效率分别降低了1.89%、6.72%,说明关键模体内氨基酸的改变对四膜虫eRF1识别终止密码子的性质产生了不同程度的影响,说明这些氨基酸可能通过影响模体的结构改变了eRF1对密码子的识别活性。为了分析保守的模体结构或模体间的协同作用对eRF1性质的决定作用。我们进一步利用搭桥PCR的方法将原生动物蓝氏贾第鞭毛虫(Giardia lambiia)和嗜热四膜虫eRF1中保守模体及其相邻区域的氨基酸分别引入酵母eRF1中,构建成由不同模体组合而成的杂合N端嵌合体,以此探究eRF1的N端区域中关键模体对eRF1识别终止密码子特异性的影响。构建的贾第虫与酵母eRF1杂合的N端嵌合体为G1(1-84aa)/Sc(76-149aa)-N 和 Sc(1-75aa)/G1(85-157aa)-N;四膜虫与酵母eRF1的N端嵌合体为Tt(1-77aa)/Sc(76-149aa)-N、Sc(1-75aa)/Tt(78-151aa)-N; Sc(1-38aa)/Tt(41-77aa)/Sc(76-149aa)-N、Tt(1-40aa)/Sc(39-75aa) /Tt(78-151aa)-N。其中1-40aa包含GTx模体,41-77aa包含TASNIKS模体;78-151aa包含Y-C-F模体。同时,对N端结构域嵌合体中的一些关键的氨基酸位点进行突变,构建成N端嵌合体的突变体。将上述N端嵌合体及其突变体基因亚克隆至酵母表达载体pDB0948中。转化第一类肽链释放因子基因敲除的酵母菌株YDB447、利用双荧光素酶报告系统和质粒洗牌技术,分析了这些不同的N端结构域嵌合体eRFl识别终止密码子的性质。结果显示,G1/Sc-N对UGA、UAG通读效率分别提高了12.80%、0.81%,而对UAA的通读效率降低了3.54%;Sc/G1-N对UGA、UAG、UAA的通读效率较野生型分别降低了3.03%、2.92%、5.69%。贾第虫的eRF1的N端结构域中引入TASNIKS模体,Sc/G1-N对于eRF1识别三个终止密码子的效率都有所提高,而引入Y-C-F模体,G1/Sc-N对于终止密码子中第二位碱基的识别有所影响。引入四膜虫eRF1的模体,Tt/Sc-N eRF1对于三个终止密码子UGA、UAG和UAA的通读效率很高,分别达到了26.39%、8.02%、10.75%,不能识别终止密码子;Sc/Tt-N eRF1对三个终止密码子的通读效率都相对较低,分别为3.97%、2.09%、3.20%,即能够同时识别三个终止密码子,由此推测GTx和NIKS模体可能决定eRF1对UAG和UAA的识别。综上结果表明,四膜虫N端结构域中GTx和NIKS模体一定程度决定eRF1识别终止密码子第一位碱基U和第二位碱基A;Y-C-F模体决定eRF1识别终止密码子UGA的第二位碱基G。本研究结果为揭示肽链释放因子识别终止密码子的分子机制提供了重要的数据支持。
其他文献
雷电灾害位列联合国“国际减灾十年”中认定的十种最严重的自然灾害。根据权威部门的不完全统计,单是我国由于雷电灾害造成的人员伤亡就达到3000~4000人/年,并往往引发各种二次
信访制度作为我国特有的一种制度,该制度的产生和发展都深深地烙有中国特色。信访制度创立的初衷在于密切联系群众,了解民意,解决群众的现实问题和困难。但是随着时代的变迁,
聚偏氟乙烯(PVDF)物理化学性能优良,是一种应用广泛的分离膜材料。但是PVDF表面能低、疏水性强,有机物污染较为严重,影响膜的使用寿命和运营成本。因此,PVDF膜的抗污染性研究
媒介技术的发展与人类传播进步密切相关,技术决定论不断受到质疑与批判,其本质是技术可能成为传播的障碍。演讲提示器作为新型技术媒介,其传播功能可能为政治功能所取代,结果
与列车相关的流动现象绝大多数是湍流流动。因此,在讨论列车周围空气流场的数值模拟时,自然也离不开如何模拟湍流现象的问题。特别对于很多复杂的列车周围空气流场,如附面层分离、尾流等带有明显的分离特点的流动,除了要求高精度的计算方法和更合适的网格外,最为重要和关键的问题是采用何种湍流模型进行适当的模拟。湍流流动是自然界常见的流动现象,是一种高度非线性的复杂流动,但人们已经能够通过某些数值方法对湍流进行模拟
通过发展村寨旅游,许多少数民族地区逐渐地摆脱了贫困,但是在发展的过程中,由于外部系统与内部环境多种因素的制约,村寨旅游发展仍然存在许多的困境与挑战。文章以帕森斯AGIL
<正>为深入实施国家创新驱动发展战略,落实《建设纺织强国纲要(2011—2020)》,在全行业推进循环再利用纺织加工向广度和深度发展,实现更大范围和更高效率的资源循环利用,行业
1月2日,百度创始人、董事长兼CEO李彦宏发表内部信,宣布百度2018年营业收入突破1000亿元。信中他预测了2019年的产业趋势,认为“冰与火之歌”正在唱响:一方面,人工智能的历史
随着社会的发展、医疗改革的深入推进,人民群众健康意识不断提高,对医疗服务的要求日益增加,公立医院面临的风险也越来越多,越来越复杂。面对新形势,如何有效管控风险,建立健
指出武夷山城市旅游文化产业发展的必要性,分析评价了武夷山城市旅游文化赋有格局及开发中存在的问题,提出了城市旅游文化产业发展战略。