采用量子化学方法和ABEEM方法对选取的锌指蛋白和配体进行理论研究。1．本文采用B3LYP/6-311++G(d，p)方法，优化4个锌指蛋白分子和31个配体分子的几何构型，使用HF/STO-3G计算优化后体系的Mulliken电荷分布。使用线性回归和最小二乘法，拟合确定了ABEEM参数（包括参考电荷，价态电负性和价态硬度）。使用ABEEM参数，计算获得了4个锌指蛋白（Finger1，Finger1-1，Finger2，Finger2-2）和11个配体的电荷分布。ABEEM方法所计算的电荷分布与从头计算方法的线性相关方程斜率k接近1.0000，截距b接近于0.0000，线性相关系数R在0.9434以上。由此可见，ABEEM方法与从头计算方法相比有很好的一致性。验证了我们所拟合的ABEEM参数是合理的和可转移的，可应用于类似体系的电荷分布的计算。2.使用ABEEM方法计算了4个锌指蛋白分子和31个配体分子偶极矩，该方法所计算的偶极矩与密度泛函B3LYP/6-311++G(d，p)的结果相关性较好，表明我们所拟合的ABEEM参数（价态电负性和价态硬度）是合理的。3.利用广义Fukui函数预测4个锌指蛋白的反应活性位点，得到4个锌指蛋白上广义Fukui函数值最大的位点分别是半胱氨酸中S16，S16，S69，S72。分别计算锌指蛋白的半胱氨酸中S原子与配体相互作用的原子和孤对电子间的广义软度差的平方和sG。利用局域硬软酸碱原理中的软度匹配规则，推测出配体与锌指蛋白相互作用的强弱。4.本文还以拟合好的ABEEM参数，计算了33个锌指蛋白的电荷分布。ABEEM方法所计算的电荷分布与从头计算的有很好的一致性，表明我们所拟合的参数具有很好转移性。