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背景:肺癌已成为中国发病率及死亡率最高的肿瘤。随着基因检测技术的不断发展,精准医疗时代的到来,肿瘤的基因分型对于肺癌患者的诊断及治疗有着重要的临床意义。从血浆中分离出的循环肿瘤DNA(ctDNA)具有很大的潜力来识别非小细胞肺癌(NSCLC)中的基因突变。对于ctDNA总变异度的诊断能力的评估,包括单核苷酸变异(SNVs),插入和删除(indels)以及基因重组。检测ctDNA的液体活检是一种非侵入性技术,避免了组织活组织检查的固有缺陷。然而,二代测序(NGS)检测血浆ctDNA中检测基因突变却没有广泛开展。方法:在本研究中,我们匹配了39名来自中国晚期非小细胞肺癌患者的组织与血浆样本。该39名患者均为依据国际抗癌联盟(Union for International Cancer Control,UICC)第八版肺癌分期为IIIb-IV期的肺癌患者。组织病理取材方式为组织活检或手术。对于血浆及组织样本的二代测序(NGS)检测是在IlluminaHiSeq平台上进行的,同时我们将传统测序试验方法加以改进。对于融合基因突变以及超低频率突变的组织样本使用其他常用临床方法(FISH、Sanger测序或免疫组化)进行验证。结果:在这个研究群体中,包括20名女性和19名男性。患者均诊断为IIIa期到IV型的NSCLC。总共39例患者中34例(87%)为腺癌,5例(13%)为鳞状细胞癌患者(13%)。我们具体检测的基因突变见图4。有18例患者(47.43%)的组织DNA和血浆ctDNA均检测到突变,12例(30.27%)患者两个样本中都没有发现体细胞突变(30.77%),8例患者只有发现突变来自于组织标本的突变(21.80%)。没有发现仅血浆样本存在突变的情况。组织DNA和血浆ctDNA之间的基因突变的总体一致性为78.21%。在血浆ctDNA中检测到的表皮生长因子受体(EGFR)、KRAS、PIK3CA突变和基因重组的灵敏度分别为70.6%、75%、50%和60%。结论:血浆中的ctDNA可能会成为晚期NSCLC患者癌症相关突变的替代来源,而ctDNA的靶向测序为精确的诊断提供了一个充满前景的未来,将成为对NSCLC患者进行临床监测的可行选择。