2004年以来，中央连续发布了10个关于“三农”问题的一号文件，而最近的“十二五”规划以及《金融业发展和改革“十二五”规划》也提到了要促进农村经济发展，加大对三农的投入，改革农村金融体系。可见，“三农”问题一直是中央工作的重中之重。但是，促进农村经济发展光是加大农村的资金投入是不够的，关键是要提高农村资金的配置效率。为了从财政和金融的角度解决“三农”问题，找出提高农村资金配置效率的方法，本文在验证农村金融市场分割的背景下，运用DEA方法测算了2001-2010年间广东省17个农村地区的资金配置的技术效率和规模效率，结果表明整个农村财政和金融资金配置是非有效的且处于规模收益递减阶段。利用Tobit回归分析发现，农村金融市场分割并没有造成资金配置效率损失。而政府对经济的参与程度越深，对农村资金配置效率的负面影响越大。城乡二元经济结构制约广东农村资金有效配置。同时，由于缺乏有效的农村市场投融资机制，金融中介机构对资金配置的作用并未显现。