随着XML相关标准的推广与应用，Web上出现了大量的XML文档。为了有效的管理，有必要将XML文档存储到数据库中。存储方案已成为XML数据管理领域研究的一个重要课题。纯XML数据库充分考虑到XML数据的特点，以一种自然的方式来处理XML数据，能从各方面很好地支持XML的存储和查询，并且能够达到较好的效果，所以纯XML数据库存储是很有研究价值的。 本文从XML和纯XML数据库等基础知识入手，分析了XML数据在原生数据库的存储方式，并深入研究了纯XML数据库Natix系统。发现其中存在的问题，记录之间往往要保存一定数量的“结构信息”以保证数据还原的正确性，这就使得记录之间不是相互独立的，记录间的不独立将会影响到XML更新的效率。本文针对Natix系统不足之处进行改进，将改进后的系统命名为NatixUp系统，它可以完全保留XML树结构信息，同时具有如下特点：为便于查询结点结构信息并有效支持更新，对XML文档数据给出基于前缀整除的编码方案；存储记录间相互独立，进行更新时可以减少XML存储及索引的修改，减少了更新的代价；并给出一种基于空间利用率的XML存储更新算法及基于父子关系聚簇的分裂子树算法。NatixUp系统能够从理论上有效的支持更新。 最后，通过实验对NatixUp系统进行了验证，实验结果表明，NatixUp系统和Natix系统相比较具有较高的更新效率。