地理标志是用于商品上的具有特殊地理来源和与原产地相关的品质或声誉的标记，特定的地理环境造就了特定产品所独有的品质，而地理标志可使这种品质得到相应的经济利益。因此，地理标志知识产权保护制度已成为当今世界上多数国家有效保护本国特色产品所采取的通行做法。虽然地理标志的使用并不限于农产品，但由于农产品通常都具有源于其产地的品质并受当地诸如气候和土壤这些特殊地理因素的影响，因此，地理标志对于农产品的保护具有重要意义。在国际上，法国是最先设立专门法保护地理标志的国家，其保护对象大多为农产品与食品。近年来，随着我国经济的发展及与世界经济的接轨，我国越来越多的农产品申请了地理标志保护，取得了良好的经济和社会效益，出现了一些知名度很高的地理标志产品，如陕西苹果、绍兴黄酒、龙井茶等。但是，在地理标志的申请与使用的过程当中，还存在着一系列的问题。人们对地理标志的作用与经济效益还没有充分的认识，地理标志的淡化与滥用现象同时并存。从目前国内的研究来看，对地理标志的研究大多是限于知识产权等法律角度，从经济角度研究地理标志的还很少，且大多数只是停留在描述性分析的层面，普遍缺乏深入地研究，目前还没有人对地理标志问题进行过系统的定量分析。鉴于此，本研究总结并借鉴国内外的相关研究成果，针对地理标志保护的经济效益问题展开研究：首先运用相关的经济学理论，对地理标志保护问题做经济学分析及理论探讨，解释了地理标志影响经济效益的原因；然后在介绍了中国地理标志发展现状的基础上，引入陕西苹果地理标志进行案例分析，详细研究了地理标志的申请过程及其积极作用，分析了地理标志对陕西苹果的价格，出口和农民收入的影响；最后在理论研究及案例分析的基础上，使用面板数据模型实证分析了申请地理标志对苹果价格、成本纯收益率的影响。本文的研究结论表明：申请地理标志对苹果的价格有显著的正效应，即申请地理标志可以使每50公斤苹果价格提高13.46元；申请地理标志对苹果的成本纯收益率有明显影响，在其它条件不变的情况下，申请地理标志可以使苹果的成本纯收益率提高20.78％。最终论文根据理论分析及实证结论，在制度安排及具体操作上对我国地理标志保护制度的建设与完善提供了可行的政策建议：国家应完善对地理标志的法律保护；明确地理标志保护部门的职责权限；政府应加强对地理标志的监督与管理工作；地方政府在地理标志申请中应发挥主导作用。本研究第一次定量分析了地理标志对经济效益的影响，提出了一个较为完整的分析地理标志经济效益的思路。