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目的：调查中缅边境间日疟原虫氯喹敏感性及其可能分子标志物Pvmdr1的基因多态性。方法：(1)将分离自中缅边境经镜检与PCR确认的间日疟患者的血样进行短期体外培养，采用微量法检测间日疟原虫对氯喹的药物敏感性，并计算各间日疟原虫样本的氯喹IC50值。(2)应用PCR扩增间日疟原虫多重耐药蛋白1（Pvmdr1）基因片段、产物测序，与标准株Salvador I进行序列比对，并分析结果。结果：（1）40例中缅边境间日疟原虫氯喹IC50值2.116~713.2nM，几何均数（Geometric mean）、95%CI（95%CI of geo. Mean）及中位数（Median）分别为88.82nM、59.3~133nM和86.82nM。其中8例间日疟原虫样本氯喹IC50大于220nM。（2）成功扩增并测序上述进行氯喹敏感性测定样本中25例样本的Pvmdr1基因，经过序列比对分析，发现3例存在Y976F突变（突变率为12.00%），16例存在F1076L突变（突变率为64.00%），3例Y976F、F1076L双突变（突变率为12.00%）。（3）氯喹IC50大于220nM的8例样本中6例测序成功，其中1例存在Y976F突变（突变率为16.67%）、4例存在F1076L突变（突变率为66.67%），1例Y976F、F1076L双突变（突变率为16.67%）；而氯喹IC50小于220nM的32例样本中19例扩增并测序成功，其中2例存在Y976F突变（突变率为10.53%），12例存在F1076L突变（突变率为63.16%），2例Y976F、F1076L双突变（突变率为10.53%）；在氯喹IC50大于220nM的样本中与氯喹IC50小于220nM的样本之间Pvmdr1基因Y976F突变率、F1076L突变率及Y976F、F1076L双突变率均无显著差异（P＞0.05）。结论：（1）中缅边境地区存在氯喹敏感性降低的间日疟原虫虫株。（2）中缅边境间日疟原虫Pvmdr1基因存在Y976F突变、F1076L突变以及Y976F、F1076L双突变现象。（3）未发现Pvmdr1基因Y976F突变、F1076L突变及Y976F、F1076L双突变与中缅边境地区间日疟原虫氯喹敏感性降低存在关联。