长期以来,强奸罪案件在司法实践中往往存在颇多争议,其中一个争议焦点就在于证据问题,相当数量的强奸罪案件存在证据争议,影响对犯罪嫌疑人、被告人的定罪量刑。究其原因,既有因性行为隐密性造成大量强奸案件直接证据“一对一”的特点,也与强奸案件独特的证明方法相关。本文以北京市东城区人民检察院2006-2008年间审查起诉的强奸罪案件为研究对象,通过研究检察机关对上述案件的案件分析报告、人民法院判决书、裁定书等材料,总结该地区强奸罪案件共同的行为特点与证据特点,以及各犯罪构成要件的证据分析和认定依据(特别是典型、疑难案件的证据分析方法),结合有关刑事证据证明方法的理论,归纳总结了基层司法机关办理强奸罪案件所特有的证据审查技巧、证明方法以及矛盾排除规则,充分论证了强奸罪中常见的认定难点的证据甄别方法。在此基础上,作者提出了强奸罪案件不必追求证据无任何矛盾,而应以追求法律真实为目标,从全案证据出发,采取心证与印证相结合的证明方法,得出最后结论。并以此提出了基层司法机关办理强奸罪案件的证据标准。