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水体浮游植物的生长繁殖与众多因素密切相关,本研究选择太湖流域浙江片区典型山区(苕溪)及平原型河流(嘉兴河网)进行布点采样调查,得到这两种类型水体总氮、总磷、COD的污染水平；同时,利用悬浮叶绿素a和底栖叶绿素a两种初级生产力水平来表征水体中藻类现存量和营养化程度,采用SOM分析环境因子间的多重响应关系,并在国际公认的叶绿素a限值基础上,针对不同河流类型分河段确定氮磷阈值。秋夏(2011年9月和2012年6月)两次采样结果表明,苕溪流域干流总氮、总磷、COD的平均浓度分别为2.2mg/L、0.20mg/L、31.2mg/L,支流总氮、总磷、COD的平均浓度分别为2.8mg/L、0.16mg/L、19.2mg/L,硝态氮为苕溪总氮最主要的存在形式,总磷以颗粒态磷和有机磷为主。整个苕溪流域干流大部分点位的氮磷比在7～22.6之间,支流的氮磷比平均值为23.1,较多数处于磷限制状态。嘉兴平原河网区总氮平均值为5.2mg/L,其中硝态氮浓度占总氮的52%,总磷的平均值为2.3mg/L,主要形式为颗粒态磷,COD平均值为109.3mg/L,氮磷比较小(0.7～9.0),整体处于氮限制状态。苕溪干流悬浮叶绿素a、底栖叶绿素a的平均浓度分别为6.8μg/L、21.6mg/m2,苕溪支流悬浮叶绿素a、底栖叶绿素a的平均浓度分别为3.5μg/L、41.8mg/m2,河网区悬浮叶绿素a、底栖叶绿素a的平均浓度为10.2gg/L、149.3mg/m2,营养化水平高。观测期内,苕溪干、支流水温平均值分别为20.7℃和20.2℃,氧化还原电位均在100-300mv,苕溪干流和支流以弱碱性为主,pH值平均值分别7.7、7.8,苕溪流域整体浊度差异较大(10NTU-1106NTU),干、支流溶解氧水平较为接近,分别为5.2mg/L和6.1mg/L。嘉兴平原河网区平均水温为25.2℃,呈弱碱性(pH=7.4),氧化还原电位平均水平为164mv,呈氧化性,浊度不高,平均水平为61.1NTU,溶解氧DO较低,平均值为4.0mg/L。此外,SOM多重映射分析表明两个区域的T、总氮、总磷、DO和悬浮叶绿素a神经元图均表现出较为一致的变化趋势,具有一定的相关性。通过水体悬浮叶绿素a与总氮、总磷关系分析,发现苕溪干流总氮阂值为0.9mg/L,总磷阈值为0.05mg/L,支流的总氮阈值1.3mg/L,总磷的阈值0.05mg/L,河网区总氮阈值为1.4mg/L,总磷阈值为0.3mg/L,河网区的总氮总磷污染严重,其阈值的计算结果也相对较高,氮磷生态阈值评估方法对其他类似河流面源污染控制具有参考价值。