企业科研机构作为国家科学研究的重要阵地之一,其承担着为建设创新型国家做出显著贡献的任务。随着科技攻关项目的不断增多,如何对其科研项目进行高效管理,保障科研机构创造效益最大化,对现有科研管理流程优化再造成为值得探索研究的课题。A集团环保研究所作为一个企业科研机构,其在科研管理方面体现的具体情况及实际问题,在我国企业科研机构中具有代表性和普遍性。本文以它为研究对象,运用管理流程再造和项目管理理论与方法,结合环保研究所现状实际需要,优化再造其科研管理流程,优化再造全生命周期管理流程,提高其科研管理水平,试点应用验证管理流程再造能取得较好效果。该研究有利于管理流程再造、项目管理理论应用研究、科研管理理论的发展,能为企业管理决策提供科学的依据,对于后续学者继续进行管理流程再造研究提供借鉴,也为其他企业进行科研管理流程再造提供一些参考,探索出适合自身情况的科研管理体系、方法。本文优化再造的科研管理流程,在环保研究所只是进行了试点实践应用,如何把流程再造、项目管理相关理论与实际的科研项目实践有效的全面结合,还有许多值得探索的内容,有待进一步研究。