宋代史籍中出现的“吃菜事魔”一词与摩尼教的关系,以及摩尼教与宋元以降东南沿海一带农民起义的关系问题,历来倍受学术界的关注,并出现了一批有价值的研究成果。虽如此,学界对“吃菜事魔”与摩尼教的关系目前还没有达成共识,而对摩尼教与农民起义的关系,只是从某一个起义是否为摩尼教所发动,或发动这一起义的首领是否是摩尼教教首或信徒这一角度出发做出判断,对于摩尼教为何能与农民起义产生联系这一问题则很少有人触及。诚然,学界之前对于此问题的解决受到史料条件的限制,但随着近期有关摩尼教资料的相继发现,使得这些问题的解决成为可能。近来,以福建为中心的东南沿海一带不断发现相关的摩尼教遗存,包括科仪文书、遗址、民间族谱、碑刻等,通过对这些新材料的考古学和社会学分析,再加之对传统史料的历史学解读,可以得到这样的结论：宋代史籍中出现的“吃菜事魔”一词是官方对摩尼教的恶称,到南宋时,出于抑制非法宗教的需要,官方有意将“吃菜事魔”所指扩大,佛道也将他们所认为的异端归入“事魔邪党”之列,致使明教与“吃菜事魔”之间的关系变得晦暗不明了。南宋出现的“二会子”、“金刚禅”等,前贤大都认为是秘密教派的名目,实则是明教徒所修炼的法术名称。在南宋大力禁断“吃菜事魔”的氛围下,明教徒开始崇尚武力以自保,向家族化、师承化转型,并有严密的宗师体系和堂口组织,而这种特征又极易被农民起义者所利用,所以宋元以降的农民起义运动多与摩尼教息息相关。