社会创业生态系统是以“社会责任”为纽带、合作共生为基础、资源互补为目的，由主导社会企业和政府、非营利组织等生态群落通过跨部门协作，并在外部环境的作用下形成的基于共同使命和价值导向、互利共生、协同发展的社会创新体系。作为系统核心的主导社会企业，选择合适、有竞争力且相容的合作伙伴组成核心团体，既关系到社会创业生态系统的运行绩效和成败，也关系到系统功能的整体发挥。因此，本研究开展社会创业生态系统中主导社会企业合作伙伴选择研究具有重要的理论和现实意义。本文引入生态位理论、共生理论、资源依赖理论、社会资本理论等相关理论，在对国内外相关研究成果进行归纳与分析基础上，剖析社会创业生态系统中主导社会企业合作伙伴选择的机理：分析了社会创业生态系统的社会价值导向性等显著特征，社会企业在系统中的跨部门链接性等主导优势，其由创业生态群落和支撑环境组成的系统结构以及资源整合、互惠共生等系统运行机制；运用Shapley值法进行了主导社会企业与候选合作伙伴间的合作博弈分析，并基于共生理论分析了主导社会企业与系统其他主体合作产生的共生效应；提出了主导社会企业非营利组织类合作伙伴选择应考虑的组织协同性、持续发展能力等因素，及其传统商业企业类合作伙伴选择应考虑的企业间相容性、社会效益、管理能力等因素。然后，本文在广泛参考相关文献资料基础上，结合主导社会企业选择合作伙伴应考虑的因素，并辅以专家咨询，初步构建出主导社会企业非营利组织类合作伙伴与传统商业企业类合作伙伴的选择评价指标体系，并运用问卷调查法对指标的重要性程度进行量化，通过分析指标鉴别力和相关性进行指标筛选，形成了2套分别由4个一级指标和16个二级指标、5个一级指标和19个二级指标构成的主导社会企业非营利组织类与传统商业企业类合作伙伴选择评价指标体系。最后，选定S市的C集团为评价主体，采用AHP模糊综合评价法进行主导社会企业合作伙伴选择指标体系的实例运用，不仅帮助C集团确定了候选合作伙伴选择的优先顺序，找出了最佳合作伙伴，也验证了所构建评价指标体系的合理性与可操作性。最后本文简要地总结了主要的研究结论、创新点，并指出了本研究的研究局限及一些需要继续完善和进一步研究的地方。