利用生物信息学分析鉴定胰腺癌关键基因

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Lossed
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:通过生物信息学的方法,寻找在胰腺癌中差异表达的基因,同时分析差异表达基因在胰腺癌中生物学作用,探讨其与胰腺癌的关系。方法:利用GEO数据库中的数据集寻找差异基因。利用DAVID数据库进行差异基因的生物学分析。利用STRING数据库进行蛋白相互作用分析,并用Cytoscape软件识别蛋白互作网络中最重要的模块,筛选出关键基因并进行功能富集分析。利用cBioPortal数据库中肿瘤患者的临床数据,对关键基因进行生存分析。同时利用Oncomine数据库中数据集验证关键基因表达情况,并分析关键基因与肿瘤分级、分期、分子标记和药物敏感性的关系。结果:本研究从基因表达综合数据库(GEO)下载基因芯片GSE28735、GSE15471和GSE62452,以确定在胰腺癌癌变和进展中起作用的候选基因。最初,在三个数据集中共鉴定出219个差异表达基因,其中161个上调基因,58个下调基因。通过富集分析确定了这些基因的功能和途径。结果表明,差异基因参与了细胞粘附、细胞外基质组织、蛋白水解、钙离子结合、丝氨酸型内肽酶活性、胞外小体、质膜、胞外区和胞外间隙的变化。在此基础上,构建了蛋白质相互作用网络,并将219个差异基因加入到网络中。在网络中鉴定出10个关键基因。选择最重要的模块进行功能和通路分析。生存分析表明,FN1和POSTN可能参与胰腺癌的癌变或侵袭。本研究所鉴定的差异基因和关键基因有望成为胰腺癌预后和治疗的候选靶点。结论:总共鉴定出219个DEG和10个关键基因。此外,FN1和POSTN的高表达可能是低生存率的一个预测因子。这些关键基因可能为胰腺癌的检测和治疗开辟了新的可能。
其他文献
日益严峻的能源及环境问题已经引起社会各界的广泛关注,将绿色能源太阳能直接转换为电能的光伏电池也随之成为研究热潮。其中聚合物太阳电池由于其克服传统无机太阳电池生产成本高、不易加工等缺陷,同时具备易加工、质量轻、低成本等优点,现已成为太阳电池研究领域的主流。近年来发展的非富勒烯小分子受体光伏材料,具备吸收强、能级可调等特性,其与聚合物给体材料构筑的叠层结构光伏电池,能量转换效率已达到17%。鉴于带隙和
如今,摩擦电纳米发电机(TENG)已成为最受欢迎的能量收集技术之一,该技术将废弃的机械能转化为电能以进行再利用。为了制造更高效率的更好的能量转换,已经做出了巨大的努力来
管壳式换热器常被用作天然气液化流程中的预冷冷凝器,是液化流程中的关键换热设备。管壳式换热器在用于天然气液化预冷流程时,天然气混合冷剂流经换热器壳侧,低温海水流经换
甲基取代的胺(N-CH3)作为生物活性化合物广泛应用于化工医药等行业。过去合成胺甲基的方法多采用有毒的甲基化试剂,例如甲醛、甲烷卤代物(CH3X,X=I,Br,Cl),硫酸二甲酯(DMS)、
目的:尽管我国在脑卒中预防策略和治疗策略方面取得了重要进展,但其仍是我国死亡的主要原因。而中国农村不论患病率还是死亡率均高于城市,因此我们旨在了解辽宁农村脑卒中患
能源是现代经济发展的支柱,是经济繁荣的基础。随着社会的发展,能源需求日益增长,随之带来了严峻的气候问题,能源行业的温室气体排放不容小觑。清洁能源转型已成为大势所趋,
电机是现代工业生产中最重要的机械设备之一,促进社会生产力的不断提高,其使用寿命、运行性能、生产成本等问题对整个社会生产和经济发展具有重要的影响。无轴承永磁同步电机(bearingless permanent magnet synchronous motor,BPMSM)集成了磁悬浮轴承和永磁同步电机的优点,具有传统电机难以实现和替代的优势,成为特种电气传动领域研究的重要方向。为了改善电机气隙磁密的
光动力治疗(PDT)作为新的癌症治疗方法受到人们广泛关注,它具有微创性、无耐药性、局部治疗等优点,在临床治疗浅表性肿瘤中取得了非常好的效果,更值得一提的是PDT治疗成本低,具
“苏幕遮”为胡语,源自古波斯的仪式活动,距今已有1600年的历史,集考古、艺术、文学价值于一身。作为外来文化在我国融合发展的产物,有着文化性、地域性的特点。通过对《苏幕
天然产物全合成作为有机化学领域中的重要分支,有着不可忽视的作用,它对于有机化学的开拓以及发展有着很重要的意义。六取代苯化合物及其衍生物作为一类很重要的有机物,很多的天然产物以及药物分子都含有六取代苯环的骨架结构,本文对很多六取代苯天然产物的相关活性进行了简单的综述,并对相关天然产物的合成策略进行了总结,对于本课题开展六取代苯类化合物及其衍生物的合成研究具有指导意义。天然产物Dimethylorse