随着农业市场化、规模化、现代化程度不断提高,单纯依靠农民的单打独斗个体经营的局面,己无法满足日益扩大的市场要求。为顺应现代化农业生产发展,一种新型的经济组织——农民专业合作社迅速发展。新疆维吾尔自治区农业大县之一,笔者工作所在地的奇台县也在此列。农民专业合作社在新疆维吾尔自治区农业发展中占据十分重要的地位,但对该领域的研究还比较少,尤其是对奇台县的研究十分稀少。从2011年初开始,该县大规模推进农民专业合作社,目前已经注册农民专业合作社863家,注册资金18亿元,涉及种植业、畜牧业等多个行业。经调研发现,目前该县实际运行并发挥作用的合作社490家,合作社注册资金87521.17万元,入社成员27140户。本文以这490家合作社为研究对象,根据交易费用理论、农户集体行动理论、农业产业化经营理论,运用文献研究、实地询问、走访调查、数据统计、案例分析等方法,第一次系统深入的分析了该县农民专业合作社的发展情况。本文将该县农民专业合作社的管理模式归纳为以下六种模式:“龙头企业+合作社+基地+农户”管理模式、“合作社+基地+农户”管理模式、“公司+村党组织+合作社+农户+基地”管理模式、“合作社+农户”管理模式、“公司+合作社+农户”管理模式、其他管理模式。选取“龙头企业+合作社+基地+农户”、“合作社+基地+农户”、“公司+村党组织+合作社+农户+基地”管理模式三种覆盖面广,运行良好的管理模式,分别选取具有典型代表的奇台县粮都农业服务专业合作社、奇台县鑫牧牧业草畜联营专业合作社奇台县半截沟镇腰站子村丰裕农业服务专业合作社做案例分析,通过分析奇台县农民专业合作社的管理模式,对比其优势劣势,分析奇台县农民专业合作社的发展问题和成因,3种主流管理模式的利弊优缺,探寻出适合该县合作社发展的模式,为奇台县政府出台完善相关政策法规,农民专业合作社的发展和完善,企业、农户在组织建设合作社时可以选择的管理模式等提供对策建议。