【摘 要】
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目的:基于生物信息学方法,从公共数据库中筛选出胰腺癌差异基因。对差异表达基因进行生存预后的可视化分析。结合预后分析及相关文献挑选出KRT19基因进一步研究其在胰腺癌诊断、预后和免疫浸润等方面的价值,讨论KRT19在胰腺癌相关发生发展过程中的作用。方法:通过访问GEO数据库筛选并下载胰腺癌相关数据集,筛选出关键差异基因并利用GEPIA数据库验证;TCGA数据库进行差异基因生存预后分析;对筛选出的关键
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目的:基于生物信息学方法,从公共数据库中筛选出胰腺癌差异基因。对差异表达基因进行生存预后的可视化分析。结合预后分析及相关文献挑选出KRT19基因进一步研究其在胰腺癌诊断、预后和免疫浸润等方面的价值,讨论KRT19在胰腺癌相关发生发展过程中的作用。方法:通过访问GEO数据库筛选并下载胰腺癌相关数据集,筛选出关键差异基因并利用GEPIA数据库验证;TCGA数据库进行差异基因生存预后分析;对筛选出的关键差异基因KRT19在消化道恶性肿瘤中非配对样本及配对样本中的表达,分子亚型和免疫亚型表达,诊断及预后价值进行分析;构建KRT19交互蛋白网络进行GO和KEGG富集分析;TCGA数据库进行KRT19在胰腺癌中的表达与不同临床特征关系分析及单因素和多因素Cox回归分析,并分析其在胰腺癌中的共表达基因及其在高低表达组中的差异基因及与免疫细胞浸润的相关性。结果:从GEO数据库中共筛选出1213个差异基因,GEPIA数据库验证了上调差异表达Top20的基因,S100P、KRT19、CEACAM6显示较好的差异性,KRT19差异性显著并显示出极高的预后价值,选择KRT19作为关键基因行多组学联合分析。HPA数据库显示KRT19在食管、唾液腺和膀胱的正常组织中高表达;在消化道恶性肿瘤中,与正常组织相比KRT19在CHOL、PAAD和ESCA的表达结果差异显著。TISIDB数据库分析结果显示KRT19在多种消化道恶性肿瘤的不同分子亚型和免疫亚型中差异表达。展示了KRT19相关Top50互作蛋白,明确了分子生物学功能及参与的信号通路;KRT19在消化道恶性肿瘤中具有较高的诊断和预后价值;单因素和多因素的Cox回归分析结果显示临床分期和KRT19表现出与OS显著的相关性;可视化KRT19在胰腺癌中正负相关共表达基因各Top10的基因;对肿瘤组中KRT19高低表达组的差异基因进行了GO和KEGG富集分析,实现了枢纽基因的筛选和可视化;验证了KRT19的表达或拷贝数变异与胰腺癌免疫细胞浸润具有相关性。结论:KRT19可作为胰腺癌诊断、预后和免疫相关的分子生物标志物,在胰腺癌的发生发展机制中具有重要作用。
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