电喷雾质谱法研究鸟嘌呤四链DNA的结构性质

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电喷雾是软的离子化技术,稳定分子的非共价相互作用在离子从液体相转移到气体相的过程中可以不被破坏;而且电喷雾质谱具有分析速度快,灵敏度高等优点。因此在测定分子间相互作用和化学计量方面都显示出特殊的优势。电喷雾质谱的方法已经被用于蛋白和核酸结构性质的分析,能够提供其他分析方法不能提供的结构信息。本论文主要运用电喷雾质谱技术,结合圆二色谱技术从以下两个方面研究了由不同的富含鸟嘌呤的寡聚脱氧核糖核酸(DNA)序列形成的四链结构方面的性质:1.利用电喷雾质谱结合圆二色谱技术,对T30175与T30923序列以及在其基础上设计而得到的九条序列在醋酸铵溶液中形成的三维结构进行研究。有报道指出,T30175和T30923两条序列与93delDNA序列一样折叠成四链结构后,均具有纳摩尔级的抗艾滋病毒整合酶的活性。由T30175和T30923衍生得到的其他九条序列与他们相比,则显示不同的热力学稳定性和抗艾滋病毒整合酶的活性。我们的质谱与圆二色谱测定的结果显示,除T30677序列以外,其他序列也都能够形成DNA鸟嘌呤四链结构。同时指出其形成的双分子四链结构与93del形成的鸟嘌呤四链结构相似。进一步,我们将测定结果与报道的IC50或EC50值进行对比,初步归纳了DNA鸟嘌呤四链结构与抗区滋病毒整合酶的活性之间的关系。2.运用电喷雾质谱对互锁式双分子DNA鸟嘌呤四链结构进行研究。在一定浓度的醋酸铵溶液中,对16条DNA序列进行研究。将测定结果与93del序列形成的互锁结构的结果进行比较。结果表明,如果在序列5’端具有由四个连续鸟嘌呤组成的结构单元,则其具有形成互锁式双分子DNA鸟嘌呤四链结构的能力;而当此序列单元位于序列中间时,则没有此种趋势。同时,短的胸腺嘧啶环(一个或两个胸腺嘧啶单元),不影响互锁式双分子DNA鸟嘌呤四链结构的形成。本研究为从DNA序列出发预计可能形成的双分子互锁的DNA空间结构提供了有价值的信息。
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