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目的：①探讨PPARγ基因17个多态性位点在哈萨克族MS与对照组中的分布以及是否存在连锁不平衡现象；②探讨PPARγ基因17个位点多态性及其单体型与哈萨克族MS的关系。 方法：①在现况调查建立的数据库基础上，随机抽取哈萨克族MS患者250例作为MS组，并从同一人群中随机抽取哈萨克族非MS个体250例作为对照组；②应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOFMS）技术检测位点多态性；③统计学分析主要采用χ2检验、t检验、单因素logistic回归分析等。连锁不平衡和单体型分析分别采用Dataanalyser0.34、Phase软件进行处理。 结果：①rs3856806MS与对照组CT基因型、TT基因型、T等位基因频率分别为（CT基因型：17.55％vs29.10%，P=0.003；TT基因型：3.67%vs2.46%，P=0.628；T等位基因：12.53%vs17.01%，P=0.044）；rs12490265MS与对照组AG基因型、AA基因型、A等位基因频率分别为（AG基因型：52.25%vs57.38%,P=0.075；AA基因型：5.71%vs9.84%，P=0.029；A等位基因：31.84%vs38.52%，P=0.029）；rs1797912MS与对照组CA基因型、CC基因型、C等位基因频率分别为（CA基因型：47.75%vs48.77%，P=0.204；CC基因型：11.43%vs18.85%，P=0.009；C等位基因：35.31%vs43.24%，P=0.011）；rs1175543MS与对照组GA基因型、GG基因型、G等位基因频率分别为（GA基因型：59.18%vs59.84%，P=0.174；GG基因型：11.02%vs17.62%，P=0.013；G等位基因：40.61%vs47.54%，P=0.029）；②rs3856806、rs12490265、rs1797912和rs1175543基因型和等位基因频率在MS和对照组间差异有统计学意义（P均<0.05）；③rs3856806CT/TT与CC基因型携带者相比，TG水平降低，HDL-C水平增高（P均<0.05）；rs12490265AG/AA与GG基因型携带者相比，SBP和DBP水平显著降低（P均<0.05）；rs1797912CA/CC与AA基因型携带者相比，MS各组分无显著性差异（P均>0.05）；rs1175543GA/GG与AA基因型携带者相比，MS各组分无显著性差异（P均>0.05）；④rs1797912与rs1175543、rs12490265与rs1175543之间存在强的连锁不平衡；⑤rs3856806、rs12490265、rs1797912和rs1175543位点之间存在14种单体型，但是只有AGCC和GAAT这两种单体型频率在MS与对照组间的差异有统计学意义（χ2AGCC=12.409，P=0.000；χ2GAAT=5.826，P=0.016）；⑥同时携带rs3856806T、rs12490265A、rs1797912C、rs1175543G者患MS的风险是同时携带rs3856806C、rs12490265G、rs1797912A、rs1175543A者的0.267倍。 结论：①PPARγ基因rs3856806、rs12490265、rs1797912和rs1175543多态性与哈萨克族MS的发病风险相关，T等位基因（rs3856806）、A等位基因（rs12490265）、C等位基因（rs1797912）和G等位基因（rs1175543）可能是哈萨克族MS的保护因素；②rs1797912与rs1175543、rs12490265与rs1175543之间存在强的连锁不平衡；③AGCC和GAAT这两种单体型可能是MS的保护因素；④同时携带rs3856806T、rs12490265A、rs1797912C、rs1175543G可能增强了对哈萨克族MS的保护作用；⑤rs3856806CT/TT基因型可能对哈萨克族血脂水平产生有益的影响；rs12490265AG/AA基因型可能对哈萨克族血压水平产生有益的影响。