【摘 要】
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该研究在构建成人心脏cDNA文库并进行新ESTs（expressed sequence tags）分离的基础上,综合数据库及生物信息学分析,克隆出某些与心血管系统疾病相关的基因,并进一步进行功能鉴定
【出 处】
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中国协和医科大学 中国医学科学院 北京协和医学院 清华大学医学部
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该研究在构建成人心脏cDNA文库并进行新ESTs（expressed sequence tags）分离的基础上,综合数据库及生物信息学分析,克隆出某些与心血管系统疾病相关的基因,并进一步进行功能鉴定.该文介绍其中两条新全长cDNA,即心肌特异的蛋白激酶p93和肌组织特异的细胞骨架调节蛋白NELIN,现将主要研究结果概述如下：一、我们在1p31-p21的房室间隔缺损区克隆到一新的蛋白激酶基因（GenBank ac.AF116826）该基因cDNA全长约3420bp,含一个2505bp的完整阅读框,可编码835个氨基酸分子量约为93kD的蛋白质,故将其命名为p93.结构域分析表明p93含三种结构域：N端为7个锚蛋白重复（ankyrin repeats）结构域,中间为一激酶结构域,C末端为富含丝氨酸结构域.同源性分析提示p93为整合素连接激酶（integrin-linked kinase,ILK）的远源同源基因.种系发生分析发现p93与ILK等可能同属MAPKKKs家族成员.二、NELIN（Nexilin-like ptotein）（GenBank ac.AF114264）,cDNA全长2736bp,含一1344bp的开放读码框,与大鼠Nexilin高度相似.胎儿6种及成人8种组织Northern blot杂交显示：1）NELIN仅在心脏和骨骼肌中表达,至少有2.7和4.0kb两种转录本.胎儿和成人心脏中两种转录本均表达,以4.0kb转录本表达丰度最高,2.7kb转录本次之.其中2.7kb转录本与我们所得克隆的长度相符.骨骼肌中仅表达4.0kb转录本.2）表达有时空特异性.4.0kb转录本在胎儿期心脏中的表达丰度是骨骼肌的3.4倍,至成人期,该转录本在骨骼肌中的表达反而高于心脏1.1.另外2.7kb转录本几乎不在胎儿心脏表达.RT-PCR结果发现该基因在心脏、动脉和静脉中表达.查询基因组数据库,该基因定位在染色体1p31.1.以上结果显示,NELIN是一个肌组织（心肌、骨骼肌和平滑肌）特异表达的基因,其中2.7kb转录本是心肌特异的,这也暗示其对心脏功能有特殊意义.结构域分析提示,NELIN很可能参与调节粘着斑和张力纤维形成,并参与粘着斑的信号传导.
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