党和政府一直非常重视“三农”问题,中央和地方各级政府的“三农”经费逐年以快于财政收入增长幅度增加,巨额的财政支农资金为”三农”发展提供了有力支撑,农业得到了稳定的发展,农村社会经济发展水平得到了极大的发展,农民收入得到了快速提高,农村基础设施建设取得了巨大的成就,农村生产和生活环境得到了极大的改善,财政支农资金在建设社会主义新农村中发挥了巨大的作用。为了节约财政支农资金、提高其使用效率和使用效果,近年在实践中和理论上都对财政支农资金绩效审计进行了探索,以便于更好地发挥财政支农资金的效益,更加经济、高效地建设经济发达、环境秀美、人心安定的社会主义新农村。本文在对财政支农进行理论分析的基础上,讨论了财政支农资金绩效审计的指标体系,认为除了需要考虑一般绩效审计的经济性、效率性和效果性三个方面的指标外,还必须考虑财政支农产生的生态环境影响指标,即可持续性指标,构成了财政支农绩效审计的4E体系。本文对指标体系的构成进行了详细的分析,最终形成了绩效审计的经济性、效率性、效果性和可持续性四个方面二个层次的16个指标,并对审计的方法进行了探讨,考虑到本文主要目的是对某一行政区域的财政支农资金绩效进行审计,而不是针对财政支农的某一个具体项目的绩效进行审计,同时考虑指标体系为多指标多层次的特点,确定了层次分析法作为审计技术,并以模糊评判法作为定性指标的量化方法。本文采用层次分析法建立了财政支农资金绩效审计的层次结构模型,按层次分析法确定了各指标的权数,通过对S区的调查获得了这些评价指标的实际数据,对部分模糊指标进行了量化,定量计算了S区的财政支农资金绩效得分,并进行了等级的划分,该地的财政支农资金绩效评价为合格。研究认为,层次分析法适合用于财政支农资金绩效审计,但对具体的项目应设计不同的指标体系,以正确反映这些指标与财政支农资金绩效间的关系,正确评价财政支农资金绩效。本研究成果对指导和规范财政支农资金绩效审计,提高财政支农资金使用效率,合理配置社会资源等方面具有一定的理论和现实意义。