【摘 要】
:
KpADH是来源于多孢克鲁维酵母Kluyveromyces polyspora的一种依赖NADPH的醇脱氢酶,可用于(4-氯苯基)-(吡啶-2-基)-甲酮(CPMK)的高效不对称还原。为了进一步探究和拓展KpADH在不对称还原大位阻双芳基酮底物的应用潜力,本论文以野生型KpADH(WT)为出发酶,CPMK为模式底物,合成了一系列CPMK类似底物以及四种含杂环的双芳基酮底物,以此探索KpADH的底物
论文部分内容阅读
KpADH是来源于多孢克鲁维酵母Kluyveromyces polyspora的一种依赖NADPH的醇脱氢酶,可用于(4-氯苯基)-(吡啶-2-基)-甲酮(CPMK)的高效不对称还原。为了进一步探究和拓展KpADH在不对称还原大位阻双芳基酮底物的应用潜力,本论文以野生型KpADH(WT)为出发酶,CPMK为模式底物,合成了一系列CPMK类似底物以及四种含杂环的双芳基酮底物,以此探索KpADH的底物谱,进一步通过半理性设计构建了对映互补的突变体,并解释了立体选择性调控的分子机制。主要研究内容和结果如下:为了更好的了解KpADH识别双芳基底物的分子机制,首先探究了不同双芳基底物,结果显示随着氯取代基从对位变为间位和邻位,酶的活性和选择性都随之降低,表明苯环上的对氯基团在影响KpADH催化效率和立体选择性中发挥重要作用。将对氯基团替换为对三氟甲基(5a)和对甲基(6a)后,酶的立体选择性发生反转,分别为49%(S)和83%(S)。此外,还合成了4种药用类杂环底物,分别为噻吩环、噻吩氯环、咪唑环和环戊二酮,其中噻吩氯环底物的比活力及立体选择性达到10.8 U·mg-1和81%(R),进一步证实了对位氯原子基团对于底物在活性中心的定位发挥了重要作用。半理性设计对映互补KpADH突变体以探究立体选择性规律。对底物结合口袋的位点进行定点突变,筛选参与立体选择性调控的位点,对鉴定获得的关键位点E214和T215进行饱和突变探究氨基酸分布规律。进一步迭代突变成功构建最优突变体E214I/T215S/S237A(ISA)和F161V/S196G/E214G(VGG),其中,(S)-突变体ISA可以催化还原底物5a和6a,双芳基醇产物的e.e.值>99%(S);(R)-突变体VGG可以催化还原5a和6a,产物醇的e.e.值分别达到99%(R)和98%(R)。动力学分析显示:突变体ISA和VGG对5a底物的KM值较WT(0.44 m M)有所提高,分别为0.75 m M和0.46 m M;对于底物6a,突变体VGG则与WT保持一致(1.59 m M),ISA则有所降低(0.77 m M)。为了探索KpADH的蛋白结构及立体选择性调控的分子机制,揭示KpADH对于底物5a和6a的选择性翻转机制,构建失活突变体Y164F并尝试获取底物、辅酶和酶的复合物晶体结构。对蛋白结晶条件进行优化,最终获得高质量晶体,收集到15套高分辨率晶体衍射数据,然而分子置换后并未在活性中心发现底物。通过同源建模,获得对映互补突变体ISA和VGG的同源模型,分别与底物CPMK、5a、6a进行了分子对接和作用力分析,初步揭示了双芳基酮的对位基团和KpADH底物结合口袋的空间位阻及烷基-π作用力对立体选择性调控的重要作用。综上,本研究拓展了KpADH在不对称还原系列双芳基酮底物中的应用,发现对位取代基对立体选择性的重要性,理性设计并构建了对映互补的KpADH突变酶,并基于分子对接和动力学分析初步探索了其手性识别机制。
其他文献
食材半成品具有保鲜难、易腐变质、安全性要求高等特征,从生产、配送再到销售前的各个环节对温湿度环境的要求极高,为了确保食材半成品的品质,完善的冷链物流配送体系非常关键。本文通过分析合肥市餐饮业食材半成品冷链配送的发展现状,发现冷链配送存在的一些问题,针对性地提出相关对策,目的是为了进一步提高冷链配送灵活性、时效性及服务质量,优化经济结构,促进合肥市冷链配送行业的健康发展。
近年来,伴随着新技术快速发展,数字化转型不断深入,油气行业在过程控制、数据链路建设、资产信息化管理等方面取得了一系列进展,但仍然处于数字化建设阶段。面对新冠肺炎疫情反复、人力成本上升、利润下降等因素影响,国际石油公司纷纷采取措施推动数字化转型创效。同一时期,2021年全国两会上,碳达峰、碳中和首次写入政府工作报告,这必将带来更为深刻的社会经济转型和新的能源革命。通过分析目前中国数字化发展实践,结合
天然多糖作为自然界含量最为丰富的一类生物大分子,广泛应用于食品、组织工程、生物材料和医药等领域。其中,具有高还原性的壳聚糖和对CD44受体具有高靶向性的透明质酸(hyaluronic acid,HA)逐渐成为天然多糖研究领域的热点。本研究构建了基于壳聚糖和HA的纳米探针,分别进行金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus)的检测和乳腺癌的体外成像及治疗研究。具体研
绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)是一类环境适应能力极强的条件致病菌,是引起医院感染的主要病原体之一,其感染可对囊性纤维化患者、艾滋病患者、化疗后的病人等免疫力低下人群造成致命伤害。由于该菌存在固有性、获得性和适应性抗药性的特征,加之人们对抗生素的滥用,导致其抗生素耐药性正不断增加,不断形成的多重抗生素耐药性使得绿脓杆菌疫苗的开发迫在眉睫。研究表明,人体免疫系统可对绿脓杆菌脂
抗生素的过度使用会导致细菌耐药性提高,耐药细菌尤其是具有产生物膜能力的耐药细菌的增加,会使全球细菌性感染更为严重,对人类健康构成重大威胁。其中,金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是重要的食源性致病菌之一,能够在食品加工管道等刚性材料表面形成生物膜,造成食品污染。同时,金黄色葡萄球菌也是临床中常见的一类致病菌,由于能够形成生物膜而常会黏附于植入式医疗设备和器械的表面,引起慢
蛋白质糖基化与蛋白多种生物学功能密切相关,异常蛋白质糖基化与多种癌症发生相关,具体表现为在癌症组织中出现独特的N-连接聚糖及N-连接糖蛋白。膀胱癌是发生在膀胱黏膜上的恶性肿瘤,是泌尿系统常见的恶性肿瘤之一。针对临床病例的膀胱癌糖链相关研究较少,无法全面了解膀胱癌组织的糖链信息。深度糖组学分析,不仅为未来临床检测提供癌症候选标志物,还对了解膀胱癌的发生与发展机理研究有指导作用。而采用FFPE组织切片
腈水解酶(Nitrilase,EC 3.5.5.1)是一类可以将腈类物质一步水解为羧酸类物质的酶,在多种化工品及药物中间体的生产中已被应用。然而,天然腈水解酶活性较低、是限制其进一步应用的瓶颈。基于突变体库构建和筛选的定向进化已被证明是酶分子改造的有效策略,但缺乏高通量筛选方法使得腈水解酶的高活性进化研究进展缓慢。遗传编码型生物传感器能够实时检测细胞内靶标分子的浓度,调节报告基因表达,从而将酶活与
恶性肿瘤严重地威胁着人类的健康和生命安全。肿瘤疫苗通过激活人体免疫系统清除肿瘤细胞,被认为是最具前景的新型癌症治疗手段之一。肿瘤细胞表面大量表达的肿瘤相关糖抗原(Tumor-associated carbohydrate antigen,TACA)特异性高、化学结构保守,是肿瘤疫苗开发的理想靶点。其中,具有特异性糖基化的肿瘤相关粘蛋白1(Mucin 1,MUC1)在多种恶性肿瘤中过量表达,已被广泛
水凝胶是一类由高分子交联而成,具有三维网络结构、强吸水和保水能力的软物质材料,已经被开发成各种医疗器械产品,广泛应用于创面愈合、软骨修复、伤口粘合等临床手术,并在组织工程、人工器官和再生医学前沿研究领域发挥着重要作用。虽然水凝胶材料能够有效促进创面愈合速度,但以伤口愈合的临床治疗目前仍存在较大的挑战,主要原因在于无法有效调控创面的过度炎症反应,造成创面瘢痕形成、血管化程度低,愈合质量差,缺乏生理功