RACE法扩增早期宫颈鳞癌淋巴转移相关基因(MIF)的全长及其克隆、验证

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:weihc
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目的从Ib期宫颈鳞癌cDNA微阵列筛查出的与早期宫颈鳞癌(Squamous CervicalCarcinoma,SCC)淋巴结转移相关的表达序列标签(expressed sequence tags,EST)出发,采用cDNA末端快速扩增法(RACE法)在宫颈鳞癌组织中扩增得到基因的全长,进而从基因(mRNA)水平和蛋白水平在早期SCC中进行验证,为研究早期SCC淋巴结转移的分子机制提供线索。方法首先对筛选出的与早期SCC淋巴结转移相关的EST设计引物,采用反转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCT)验证其在早期SCC中的表达;然后,对验证结果可靠的EST设计特异引物,在SCC组织中用cDNA末端快速扩增法(RACE)扩增EST所对应的基因的全长,并克隆和测序,再将测序结果进行初步的生物信息学分析;最后,用RT-PCR法检测扩增出的基因在早期SCC组织中的基因水平的表达,用酶联免疫吸附实验(Enzyme-Linked Immunosorbnent Assay ELISA)测定巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)在早期SCC患者血清中的浓度,并用RT-PCR、ELISA、免疫组织化学法(Immunohistochemistry,IHC)检测MIF在宫颈鳞癌高转移Caski细胞株和低转移Siha细胞株中的表达。结果(1)经RT-PCR实验验证,AI140221在无转移的早期SCC中的表达显著高于有转移早期SCC组织中的表达(P<0.005);AI870661、AI985548、ADCAPE03和ADCAPB08在有转移的早期SCC中的表达均高于其在无转移的早期SCC中的表达(P<0.01,P<0.005)。其中AI985548已在NCBI上申请得到了GenBank序列号:EL812776(2)对AI870661设计3’RACE的特异引物,在早期SCC中用RACE法扩增出了MIF基因,测序结果为485bp,与GeneBank中公布的MIF基因序列和蛋白序列均有95%的同源性。向NCBI递交该序列,现已取得GenBank序列号:EF492869。在该3’RACE的过程中还发现一条新的EST。该EST也已在NCBI上申请得到了GeneBank序列号:EL812774(3)MIF的RT-PCR、ELISA结果经统计学分析,其在无转移的早期SCC中的表达高于在正常宫颈组织中的表达,且在有转移的早期SCC中的表达高于在无转移的早期SCC中的表达(P<0.01,P<0.05);扩增出的新的EST经RT-PCR法的检验,其在无转移的早期SCC中的表达高于在正常宫颈组织中的表达,在转移的早期SCC中的表达高于无转移的早期SCC(P<0.01,P<0.05)。MIF在宫颈鳞癌CaSki细胞株中的mRNA和蛋白水平表达都高于Siha细胞株。结论第一次从EST出发用RACE法在早期宫颈鳞癌中扩增得到MIF基因,并在早期宫颈癌组织中发现了一条新的EST。验证了6条与宫颈鳞癌淋巴结转移相关的EST。并从组织水平验证了MIF在早期SCC中的表达显著高于在正常宫颈组织中的表达,在有转移的早期SCC中的表达显著高于无转移的早期SCC;从细胞水平验证了MIF在宫颈鳞癌高转移CaSki细胞株中的表达都高于低转移Siha细胞株。提示MIF很可能参与了宫颈鳞癌的发生和转移。进一步寻找和研究这些EST所对应的基因及对MIF因子的深入研究有利于早期宫颈癌淋巴结转移分子机制的研究。
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