西瓜食酸菌抗铜相关基因tolC和gntR的鉴定与功能分析

来源 :新疆农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiang879154
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
细菌性果斑病(Bacterial Fruit Blotch,BFB)是一种严重危害葫芦科植物的种传细菌性病害,其病原菌为西瓜食酸菌(Acidovorax citrulli)。该病害自爆发以来,在世界各地迅速传播,使得葫芦科作物受到巨大的损失。目前,使用含铜制剂是大田防控BFB的主要措施,但是铜的过量使用不仅会导致土壤污染,同时还发现了西瓜食酸菌抗铜菌株的出现。因此,探究该病菌的抗铜机制,可以为研究开发有效防控BFB的新方法、新措施提供理论依据。基于此,本研究通过对西瓜食酸菌FC440菌株的Tn5转座子插入突变体库的筛选,获得两个抗铜能力改变的突变体。利用生物信息学分析、基因功能互补等手段,鉴定出2个与西瓜食酸菌抗铜机制相关的基因,并且对基因的功能进行了验证。主要结果如下:本研究首先比较了西瓜食酸菌基因功能研究中常用的表达载体p BBR1MCS-5和p HC60对菌的生物学特性的影响。实验结果表明:表达载体p BBR1MCS-5对菌株的胞外纤维素酶活性、胞外蛋白酶活性、胞外多糖含量、游动性、致病性和诱导过敏性坏死反应能力、生长速率以及抗铜性等方面未表现出显著影响,而表达载体p HC60会显著抑制宿主菌株的生长速率和游动性。由此说明,表达载体本身会影响西瓜食酸菌的某些生物学特性,在基因功能研究中应依据所研究基因的功能选择适宜的表达载体。本研究中基因功能分析表达载体选用p BBR1MCS-5。本研究筛选西瓜食酸菌FC440菌株的Tn5转座子插入突变体库,获得2株抗铜能力减弱的突变体。利用质粒挽救法获得这2株突变体的突变位点分别与西瓜食酸菌AAC00-1菌株的Aave-1811和Aave-2798基因同源;生物信息学分析显示,基因Aave-1811和Aave-2798分别编码TolC外膜蛋白和GntR家族转录调控因子。本研究比较发现西瓜食酸菌AAC00-1、FC440、XJL12和AW0601四个菌株的tolC基因的大小相同均为1488 bp,但核酸序列存在差异,其中FC440菌株的与AW0601菌株的一致,AAC00-1菌株的与XJL12菌株的一致。结构预测分析表明,TolC蛋白可以分泌大小为18~19氨基酸的信号肽,该蛋白在20~30氨基酸处疏水性较高,存在一个跨膜区,亚细胞定位于周质空间。以TolC蛋白为标记的进化树分析显示,西瓜食酸菌与燕麦食酸菌(Acidovorax avenae)的亲缘关系较近;大肠杆菌(Escherichia coli)和鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)的亲缘关系较近。突变体FC440(?tolC)菌株在含3.75 mmol/L Cu SO4的KMB培养基上已失去生长能力,其基因功能互补菌株在含3.75 mmol/L Cu SO4的KMB培养基中生长能力部分恢复,证明TolC蛋白参与了西瓜食酸菌的抗铜机制;基因tolC的突变未影响西瓜食酸菌除抗铜性外的其它生物学特性,说明TolC未参与到该菌的这些生理活动中。西瓜食酸菌FC440菌株的GntR家族转录调控因子的基因全长为1041 bp。蛋白序列分析显示不产生信号肽,在185~195氨基酸处疏水性较高,存在一段跨膜结构域,理化性质的分析表明该蛋白为不稳定蛋白质,亚细胞定位在细胞质中。进化树分析显示,西瓜食酸菌GntR家族转录调控因子与根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)的亲缘关系较近,与大肠杆菌的亲缘关系较远。突变体FC440(?gnt R)菌株在含3.75 mmol/L Cu SO4的KMB培养基中生长能力减弱,其基因功能互补菌株在含5.625 mmol/L Cu SO4培养基中生长能力完全恢复,证明GntR家族转录调控因子对西瓜食酸菌的抗铜性有贡献;gnt R基因突变未影响菌的除抗铜能力外的其它生物学特性,说明GntR家族转录调控因子与菌的这些生理活动无显著相关性。本研究结果表明西瓜食酸菌中的TolC和GntR蛋白参与了该菌的抗铜机制。
其他文献
学位
材料的先进制备和加工过程中,伴随着金属(或合金)的液化以及随之而来的液/固界面的形成,在此阶段施加物理场,能有效地改变加工环境,为获得性能优良的产品提供了很好的条件,多场
土壤水分特征曲线和土壤导水率作为重要的土壤水动力学参数,表征了土壤水分入渗性能及溶质运移速度,是土壤水动力学、水文水资源、生态水文学等交叉学科的基础。鉴于此,本研究以西北旱区景泰县的压砂地为研究对象,通过大田采样和室内设计试验,研究了不同种植年限压砂地对土壤水动力学参数的影响,在此基础上借助经典统计学和地统计学方法对压砂地土壤水分特征曲线的空间变异规律进行了分析,并利用回归模型与分形理论对土壤水分
蓝莓学名越橘,杜鹃花科(Ericaceae)越橘属(Vaccinium spp)。采收于夏季,有着较高的呼吸代谢,采后由于营养输送的阻断进而后熟衰老。蓝莓营养价值高但因其不耐贮藏、不利于运输的特性严重影响了它的商品价值。蓝莓采后主要的问题是易腐烂软化。本试验发现蓝莓采后用1-甲基环丙烯(1-MCP)结合二氧化碳(CO_2)进行处理可以很大程度上延缓蓝莓的成熟衰老,抑制其软化,且更大程度上保持蓝莓的
本文采用理论分析和数值模拟相结合的方法,选用乌鲁木齐市大学路典型边坡,利用大型通用ABAQUS有限元软件,分析边坡的稳定性。研究抗滑桩及边坡参数对边坡稳定的影响。探讨不
三下开采中顶分层条带开采所留设的煤柱,对于控制地表移动变形起到较好效果,顶分层煤柱与下分层煤层组成的特殊回采环境,在纵向剖面上呈现为“凹凸型”的煤体。当经济技术条件成熟,需将煤炭资源全部回采时,凹凸型煤体内应力异常分布影响着下分层安全回采。本文以金桥煤矿为工程背景,通过理论分析、经验计算、数值模拟、现场观测等方法,对薄基岩下凹凸型煤体进行相关研究,完成1308工作面顺槽位置与采煤工艺选择,并完成现
政府采购是现代政府财政支出管理的重要组成部分,也是使用财政性资金进行采购而必须遵守的法定行为。随着互联网的蓬勃发展,我国在积极探索政府采购信息化建设上取得了丰硕的
ITRF2014是目前世界上一致认可的精度最高的全球参考框架,但由于其在中国区域及周边测站分布较少,无法直接通过国际地球参考框架(ITRF)获取国内高精度GNSS测站坐标。本文拟利用全球范围内均匀分布的IGS站,结合高密度SHCORS,建立高精度上海区域大地参考框架,为区域大尺度长周期的基础科学研究与国民经济建设提供准确、可靠、稳定的框架基础。论文的主要研究成果为:(1)通过径向分量检测舍去存在较
随着近年来国家海洋战略的实施,海洋石油勘探开发等海洋事业蓬勃发展,海上勘探船舶航行作业安全需求日益增加。目前基于电子海图的船舶监控系统缺少对通用GIS技术的支持,建立
S75级粒化高炉矿渣粉的研究,为了更好地节能减排发展绿色建材,解决新疆环境侵蚀性介质地区混凝土建筑物的抗侵蚀性问题,降低建筑材料造价,研究结果具有重要的现实意义和参考