本论文采用密度泛函理论(DFT)，在B3LYP/6-311+G(d,p)的水平下研究了羟基自由基(·OH)引发的DNA碱基对中碱基损伤机理，主要包括：　　1、研究了·OH与鸟嘌呤(G)，胞嘧啶(C)和G-C碱基对中碱基加成和脱氢损伤反应机理。研究结果表明，·OH对鸟嘌呤(G)的损伤，主要为NH2基团的脱氢，其次为C5加成；·OH对胞嘧啶的损伤，主要为C5位加成和NH2基团的脱氢；·OH对G-C碱基对中碱基的损伤，主要为鸟嘌呤NH2的脱氢，分支比为86.6％，其次胞嘧啶C5位加成，分支比为11.1%。鸟嘌呤NH2基团脱氢使G-C碱基对中结合能减少了5.86 kcal/mol，稳定性降低。　　2．研究了·OH与鸟苷、胞苷和鸟苷-胞苷对中碱基加成和脱氢损伤反应机理。研究结果表明，·OH对鸟苷碱基的损伤，主要为NH2基团的脱氢，其次为C5为加成；·OH对胞苷碱基的损伤，主要为NH2基团的脱氢、其次是C5位加成；·OH对DG-DC碱基对中碱基的损伤，主要为鸟嘌呤NH2的脱氢,分支比为95.2%，其次是胞嘧啶C5位加成和C6位加成的，分支比分别为2.0%和2.5%。鸟嘌呤NH2基团的脱氢使DG-DC碱基对的结合能减少了6.01 kcal/mol，稳定性降低。