村民委员会是村民行使村民权利，进行自我管理、教育和服务的基层群众性自治组织，是村民自治的执行机构。作为农村基层重要的村民自治组织，村民委员会在村民自治中发挥着重要的职能。同时，村民委员会作为村民私权利与国家公权力衔接区，在保障村民权益的同时对于推进公共事业发展，促进农村基层民主政治建设起着十分重要的作用。近年来，随着改革开放的不断深入，村民自治取得了很可观的成果，村民自治在广度和深度上都有了很大的突破。村民委员会在村民自治中的地位举足轻重，村民自治甚至在一定程度上突破了村的范围，带动了一系列的制度创新，推动了其相关领域的民主改革，在我国地方经济发展和乡镇经济发展中发挥了不可替代的作用。尽管如此，在现实生活中由于种种原因，村民自治在取得若干成效的同时，也随之出现了一些问题，如村民委员会与乡镇政府的关系、村两委关系不明确以及村民委员会履职不合理等，有效实行村民自治依然“任重道远”。因此，要想真正让村民自治制度的推行取得良好效果，必须明确村民委员会在村民自治中的职能运行的问题，以便能更好地发挥其作用，促进村民自治更好地发展。　　本文从以下几个部分展开：　　第一部分绪论。主要介绍了本文的研究目的及意义，本研究课题的国内外相关的研究动态与研究方法。　　第二部分是本文的理论基础介绍。主要包括村民委员会相关概念介绍、村民委员会职能运行分析的理论工具介绍与村民委员会职能运行基础的分析。第三部分是实证研究部分。通过对调研样本进行实地调查，分析职能运行存在的问题，分析村民委员会职能出现的越位、缺位、错位问题以及对出现问题的原因进行分析，主要是从村民的自治意识淡薄，村民参与自治缺乏积极性、法制规章不明确，村民委员会职能界定模糊、政府角色定位不明，政府行为有待规范和村党支部与村民委员会的关系有待理顺等四个方面进行论证分析。　　第四部分是完善村民委员会职能科学运行的对策建议。本文从提高村民参与村民委员会职能建设的积极性、完善法制规章，进一步明确村民委员会职能、规范政府引导机制，充分调动村民委员会管理积极性和理顺村党支部与村民委员会的关系，形成乡村治理合力等四个方面提出完善对策。　　第五部分为总结与展望。对本文内容进行总结，并对未来村民委员会职能运行发展提出展望。　　本文以山东省沂源县 D镇为例，对村民委员会职能运行情况进行实地调研，从村民委员会职能运行的基本理论入手，分析村民委员会运行现状，对村民委员会职能运行现状中存在的职能越位、职能缺位、职能错位等问题及成因进行论证分析和反思，并针对性的提出对策。从作为村民的角度对村民委员会职能运行进行分析，探究其科学运行的群众基础，是本文的研究视角创新。本文通过实地调查和走访，收集关于村民委员会的一手资料，为准确把握村民委员会职能运行奠定基础，也为进一步研究村民委员会职能运行提供素材，从村民的角度展示目前农村基层治理的客观现状和村民的现实获得感。把村民的自治意识的树立和村民的主动参与作为村民委员会职能运行的群众基础和价值归属是本文的研究观点创新。本文旨在从与农村农民联系最密切的村民委员会出发进行研究，立足乡村实际，探索职能运行出现的问题的现实表现形式及原因，并根据实际情况对存在的问题提出可行性政策支持，以期促进村民委员会职能向着明晰化、规范性、系统性的方向发展，促进我国农村治理现代化的发展和农村社会的稳定与发展。