本文利用随机扩增多态性DNA (RAPD)技术,对毛乌素沙地天然臭柏种群4种形态变异类型的遗传变异及遗传分化进行了研究,并且比较了臭柏、兴安圆柏、西伯利亚刺柏的遗传多样性,主要研究结果如下:(1)在臭柏4个形态变异类型遗传多样性分析中,用17个引物检测到201个位点,各类型样本多态位点百分率在79.10% ~85.57%之间。用Shannon多样性指数和Nei’s基因多样度估算了4个变异类型的遗传多样性,均呈现黄绿匍匐型>黄绿直立型>灰绿匍匐型>灰绿直立型的特征;基因分化系数为Gst=0.0593,94.07%的遗传变异存在于各变异类型内;聚类分析显示,臭柏枝条的生长特征受遗传控制的可能性较颜色大。(2)在臭柏、兴安圆柏、西伯利亚刺柏的遗传多样性比较分析中,用16个引物扩增出的204条带,其中共扩增出RAPD特异标记带22条,分别是臭柏6条,兴安圆柏3条和西伯利亚刺柏13条,这些特异条带都有可能是区别三种植物的特异标记。3种植物遗传多样性从大到小的顺序是:臭柏>西伯利亚刺柏>兴安圆柏。