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SARS-CoV(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus)是2002-2003年在我国暴发的SARS的病原。我们研究小组前期在菊头蝠里发现与SARS-CoV相似的病毒，命名为SARS样冠状病毒(SARS-like CoV， SL-CoV)，证实蝙蝠是SL-CoV的自然宿主。序列分析表明人SARS-CoV(Tor2)与蝙蝠SL-CoV具有相似的基因组结构，基因组核苷酸同源性为88-92％，但S蛋白的氨基酸同源性只有76-78％。人SARS-CoV和蝙蝠SL-CoV的S蛋白序列的差异必然导致它们功能上的差异。在此基础上，作者对两种病毒S蛋白与蝙蝠ACE2的相互作用、SLCoV(Rp3)的S蛋白的免疫原性、以及这两种蛋白引起的细胞差异表达基因进行了研究，旨在为研究SARS-CoV的起源、进化、致病机理，以及SARS-CoV疫苗开发提供科学依据。
第一章以综述的形式描述了SARS的暴发流行，其病原SARS-CoV的一些生物学性状及其疫苗的研究进展。
第二章，我们分别扩增了来自不同地区的5个种属的蝙蝠ACE2全长或者N端序列。利用构建的假病毒HIV/BJ01-S和HIV/Rp3-S感染瞬时表达不同蝙蝠种属ACE2的HeLa细胞，发现HIV/BJ01-S能进入表达中华菊头蝠和水鼠耳蝠ACE2的HeLa细胞，但HIV/BJ01-S对前者的入侵效率远远低于后者。HIV/Rp3-S不能进入表达任何种属ACE2的HeLa细胞。通过比较HIV/BJ01-S敏感(水鼠耳蝠)和不敏感(皮氏菊头蝠)的蝙蝠ACE2，，作者对水鼠耳蝠ACE2 N端(19-79aa)做了一系列突变，鉴定了水鼠耳蝠ACE2上对SARS-CoV进入起作用的关键性氨基酸位点I27，N31和K35。
第三章，利用腺病毒pAdEasy系统，构建包含蝙蝠SL-CoV(Rp3)全长且密码子优化的S基因的重组腺病毒rAd-Rp3-S。纯化好的rAd-Rp3-S通过腹膜注射免疫小鼠，每隔两周免疫一次，共免疫三次。ELISA结果显示rAd-Rp3-S免疫的小鼠血清能产生针对SARS-CoV和SL-CoV S蛋白的特异性体液免疫。ELISPOT检测显示rAd-Rp3-S免疫的小鼠的IFN-γ和IL-6的分泌水平高于阴性对照，表明rAd-Rp3-S免疫的小鼠也产生了细胞免疫。试验结果表明rAd-Rp3-S可以有效地在哺乳动物体内表达外源蛋白，可以作为一种潜在的活病毒载体疫苗。
第四章，分别把人SARS-CoV(BJ01)和蝙蝠SL-CoV(Rp3)的S蛋白(密码子优化)在HeLa细胞中表达，通过抑制差减杂交比较其引起的细胞内基因表达差异。在建立的差减杂交文库中，获得了和免疫反应、转录、转运、信号转导、应急反应、蛋白合成、代谢和细胞循环相关的差异表达基因谱。同时作者对9个差异表达基因做了qRT-PCR验证。这为SARS-CoV和SL-CoV感染寄主后引起的细胞内反应提供了重要的线索，同时为SARS-CoV和SL-CoV的病理学和免疫学研究奠定了基础。