禽流感是由甲型流感病毒引起的禽类传染病。甲型流感病毒宿主谱广泛,能感染包括禽类、马、猪、海豹和人等多种动物。野生水禽(主要是雁形目和鸻形目)被认为是甲型流感病毒的天然宿主,所有H1-H16和N1～N9亚型的禽流感病毒均能从它们中分离。禽流感病毒主要在禽类肠道上皮细胞内复制,并通过粪便排泄污染周围环境,其他禽类可因接触有感染性病毒颗粒的粪便而导致感染。野禽全球广泛分布,大部分野禽又具有迁徙的习性,因而就为病毒通过其进行远距离播散提供了有利条件。二十世纪七十年代北美和欧洲部分国家就开始对野禽禽流感病毒进行了长期监测。研究发现野禽禽流感病毒与家禽禽流感病毒疫情密切相关,例如位于野禽迁徙路线上的地区家禽禽流感感染率要明显高于其他地区,此外许多高致病性禽流感病毒的前体病毒可能来源于野禽中低致病性禽流感病毒,在家禽中发生突变后导致暴发。禽流感病毒具有严格的宿主限制性,但是H5、H7、H6、H9和H10等亚型禽流感病毒偶尔也可通过“直接途径”跨越种属感染人。此外,禽流感病毒也可以通过与人流感病毒发生重配产生新的流感病毒的“间接途径”导致流感大流行。因而禽流感病毒在野禽、家禽和人的跨种传播链的研究对于我们防控人流感大流行就显得尤为重要。中国幅员辽阔,有许多湖泊、河流和湿地,是鸟类栖息的重要场所,每年秋冬季有大量的野禽从北方南迁越冬,来年春季又会回迁北方。东洞庭湖位于澳大利亚和东亚野禽迁徙路线,是我国最大的淡水湖泊之一,每年冬季有大量野禽来此越冬,此外保护区周边有数量庞大的家禽养殖场,这些家禽尤其是家鸭与野禽可能有共同的栖息水域,这就为禽流感病毒跨种传播提供了有利条件。但是对于该地区野禽和家禽养殖场的禽流感病毒流行状况我们缺乏相关的研究,因而本次研究选择这里作为我们的研究地点。国家流感中心联合湖南省疾控中心、岳阳市疾控中心及湖南东洞庭湖自然保护区,于2011年11月～2012年4月,连续六个月共采集6626份野禽和家禽环境标本,并在2011年11月和2012年4月分别采集保护区内工作人员、渔民以及家禽养殖户职业人群血清共计1050份,进行禽流感病毒感染状况的横断面调查研究,以了解该地区野禽、家禽和人感染禽流感病毒状况。研究发现,2011年11月～2012年4月东洞庭湖地区的野禽和家禽禽流感病毒感染率分别为5.2%和5.3%,差异无统计学意义。但是野禽粪便中禽流感病毒的检出率明显高于湖水,说明野禽粪便采集可以很好的用于野禽禽流感病毒监测工作。2011年12和2012年3月和4月,野禽和家鸭均出现两个病毒感染率高峰。野禽和家禽中共分离到46株禽流感病毒,其中野禽禽流感病毒存在9种HA和NA亚型的组合,H9N2亚型(22株)、H1N5亚型(5株)、H5N2(3株)、H6N2(2株)、H6N1(2株)、H1N8(2株)、H1N2(1株)、H7N7(1株)和H12N8(1株)。家鸭分离到3种HA和NA亚型的组合,包括3株高致病性H5N1病毒、2株H3N6病毒和2株H4N2病毒。禽流感病毒的总分离率约为0.69%。野禽的病毒分离率约为0.72%。其中雁鸭类和鸻鹬类的分离率最高,分别为1.01%和2.22%,与北美和欧洲野禽监测的结果一致,说明这两种鸟类可能也是东洞庭湖地区野禽禽流感病毒感染的主要宿主。家鸭的病毒分离率约为0.58%,相对于我国活禽市场和规模化养殖场的病毒分离率要低很多,可能与采集的养殖户多为家庭散养户有一定关系。对这些毒株进行分子特征和系统发生分析发现,该地区野禽和家禽中流行的禽流感病毒基因主要是欧亚谱系,但是22株H9N2病毒为北美和欧亚谱系病毒重配产生的新型H9N2病毒,其中HA、NA、PA和NS基因来源于禽流感病毒的北美基因库,而且其抗原性与目前大陆家禽中流行H9N2病毒抗原性差异较大。这种跨半球的病毒基因交换在其他地区的监测中也有发现,但总体频率不高,我们发现的这种重配H9N2病毒进一步证明了禽流感病毒跨半球传播的可能性。此外研究还发现,野禽病毒H1N2的NA和PB2基因与洞庭湖野禽中分离的病毒(H5N2和H12N8)的核苷酸同源性最高；野禽病毒H1N5的PB1和PA基因与在洞庭湖野禽分离的H12N8病毒同源性最高；野禽病毒H1N5的NP和NS基因与洞庭湖野禽中分离的H7N7的核苷酸同源性最高,说明东洞庭湖地区野禽中流行的禽流感病毒之间存在着基因重配。8株野禽病毒H1的HA和1株野禽病毒H1N5的NP基因,野禽病毒H7N7的NA基因和M基因以及野禽病毒H12N8的HA、NA、PB1和NS基因均与湖南和广西家禽中分离到的禽流感病毒核苷酸同源性最高,提示这些野禽禽流感病毒与家禽禽流感病毒之间可能发生重配。对采集的1050份职业人群血清中针对人感染高致病性H5N1病毒抗体进行检测,未发现抗体阳性标本,但是在岳阳县分离到的H5N1病毒属于目前中国大陆家禽中流行的clade2.3.2.1支系的病毒,而该支系的病毒已经在中国和东南亚地区造成了几十例的人感染病例,因而虽然该地区人感染禽流感病毒的风险较低,但仍不容忽视。本次研究初步了解东洞庭湖地区野禽、家鸭和人感染禽流感病毒的状况,发现了一些之前该地区未报道过的病毒亚型,其中一些野禽毒株之间可能存在着基因交换,并且部分野禽与家禽禽流感病毒可能也存在基因重配,此外跨半球的重配病毒也野禽中检测到,因而仍需进一步加强该地区禽流感病毒的监测研究。虽然该地区人感染高致病性H5N1的风险较低,但是人感染其他亚型禽流感病毒的风险还需要进一步的研究和分析。