城市湖泊湿地生态系统是城市中的一个具有独特性质的自然资源生态系统，由于所处地理位置的特殊性及其本身所具有的特殊功能，对城市的发展起着十分重要的作用。科学评估城市湖泊湿地的生态服务功能价值，不仅可为建立区域生态账户提供基础数据，还可对制定合理的区域生态保护和经济开发决策、保护和恢复城市湖泊湿地生态系统具有重要意义。随着经济的增长，重庆市城市湖泊湿地表现出开发过度、湖泊面积萎缩、水体污染及富养化、景观缺乏特色等问题。近几年来，重庆市政府为改善城区湖泊湿地水质及生态环境，采取了清淤截污、生态修复等多种治理、保护城市湖泊湿地的手段，但面对众多湖泊的管理和治理，仍具有一定盲目性和跟从性。本研究以重庆市主城区典型湖泊湿地为研究对象，选取了彩云湖、双龙湖、孝母泉3个湖泊作为典型案例进行评价分析。在探讨城市湖泊湿地的生态服务功能内容及其价值评估的理论和方法，构建城市湖泊湿地的生态服务功能价值评估指标体系的基础上，应用城市生态学、环境经济学、生态经济学等理论和方法，研究不同人为干扰程度下，城市湖泊湿地的直接使用价值、间接使用价值和非使用价值等生态服务功能价值的差异。研究结果如下：重庆城市湖泊湿地资源各功能价值丰富，直接使用价值的价值量大小与人为干扰程度有关，间接使用价值价值量大小与城市湖泊湿地的存在及其面积大小有关。而非使用价值占有重要作用。直接使用价值为双龙湖>彩云湖>孝母泉，单位面积直接使用价值为双龙湖>孝母泉>彩云湖，直接使用价值受到湖泊面积、库容量及人类干扰的影响；间接使用价值为彩云湖>双龙湖>孝母泉，单位面积间接使用价值为彩云湖>双龙湖>孝母泉，间接价值受到湖泊自身面积、库容量的影响。而非使用价值主观性较强，跟湖泊地理位置、生态环境以及游客等因素有关，其中非使用价值三种成分的重要性程度为存在价值>遗产价值>选择价值。受访者学历、职业等对支付意愿及支付值有显著影响，而性别、年龄对支付意愿率和支付值影响不大。综合分析3个城市湖泊的生态服务功能价值，得到双龙湖>彩云湖>孝母泉。其中直接使用价值占总价值的比例为彩云湖>双龙湖>孝母泉；间接使用价值占总价值的比例为彩云湖>双龙湖>孝母泉；非使用价值占总价值的比例为孝母泉>双龙湖>彩云湖。总体表现为湖泊越大，其使用价值所占比例越大，直接使用价值和间接使用价值所占比例越大，而非使用价值所占比例越小。典型城市湖泊湿地单位面积的的生态服务功能价值为1533.22元/(年·m2），由此重庆市主城区湖泊湿地生态系统服务功能价值为292.23×10~8元/年，其中直接使用价值、间接使用价值、非使用价值分别为11.93×10~8元/年、2.87×10~8元/年、277.44×10~8元/年。由此可见，城市湖泊湿地具有强大的生态服务功能价值，因此在为人类利用的时候，一定要做到全面、合理、科学以及可持续，使得人与自然和谐发展。