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本论文研究了合浦珠母贝北海和徐闻养殖群体的形态特征、调查分析了两地合浦珠母贝养殖状况和产业发展状况；采用双列杂交设计构建了90个选育家系，研究了稚贝的附着特性、环境适应性，比较了家系生长性状、稚贝养殖方式，并进行了大珠母贝遗传多样性的微卫星分析，主要结果如下：
1、合浦珠母贝珍珠养殖产业现状的初步调查通过实地走访北海和徐闻两地养殖农户，了解到两地合浦珠母贝养殖规模已大为缩减，目前养殖场(户)仅1000家左右，育苗场60家左右，养殖人员15000左右，养殖贝约1.7亿只，珍珠产量约30吨，统珠价格仅4000元/kg左右。育珠生产中还存在大量使用低龄小贝插核、人为缩短育珠时间、技术粗糙、管理落后的现象。针对这些问题，提出了相应的发展对策，为我国珍珠产业的恢复和发展提供参考。
2、北海和徐闻养殖群体重要经济性状的遗传变异分析随机选取北海和徐闻两群体各100只22月龄合浦珠母贝，测量壳长、壳高、壳宽、韧带槽长、韧带槽宽及体重，比较分析两群体的形态特征差异。结果表明：壳长方面，徐闻群体(50～65mm)大于北海群体(40～50rm)(P＜0.05)；各性状间，除韧带槽宽外，其余各性状之间均为极显著相关(P＜0.05)，只有韧带槽宽在两群体间无显著差异(P＞0.05)；回归分析表明，壳宽与壳长呈对数相关关系，壳高与壳长、体重与壳长呈乘幂相关；多重线性回归得到两群体的回归方程分别为SLB=22.372+0.785BWB+0.242HLB和SLx：25.882+0.482BWx+0.218SHx+0.176SWx(SL、Bw、HL、SH、SW分别代表壳长、体重、韧带槽长、壳高、壳宽，B，X分别代表北海群体和徐闻群体)；两群体间韧带槽长与壳长的比值差异不显著(P＞0.05)；徐闻群体的壳色均为褐色，伴有淡色放射线，而北海群体则有浅黄、浅黄伴有放射线、金黄、金黄伴有放射线、红色、褐色等六种壳色分化。
3、北海和徐闻家系的生长比较分别采用广西北海和广东徐闻两个群体的合浦珠母贝为亲贝，建立群体内选育家系8个，生长性状及不同养殖方式的比较表明：北海家系BHLF1的各性状在不同生长时间均显著优于其他家系；个体起始平均壳长、壳高、壳宽、体重与其增长率的相关性不显著(P＞0.05)；徐闻家系XHSF16无论在海区养殖组或是池塘养殖组中生长速度均较快，而且早期成活率也较高；家系XHSF13在两种养殖环境下的壳长、壳高、壳宽的生长率均高于家系XHSF16和XHSF14，家系XHSF16的壳重增长率高于家系XHSF13和XHSF14。
4、双列杂交家系构建及评价以采自广西北海、广东徐闻、海南三亚的3个地理群体为亲贝，按照完全双列杂交的方式，建立了9个交配组合，每个组合10个家系，共90个家系，比较各家系的育种值，并对家系进行综合评价：壳长的Kung育种值大于20的家系有8个，分别为BX2、BX9、BB4、BB5、BB8、BS9、XS3、SB8，其中XS3有最大的壳长及壳宽的Kung育种值和综合评定值，XX3最小。BB4和XS3的综合评定值大于1。
一般配合力、特殊配合力和杂交优势分析表明，在稚贝生长期，北海群体的亲贝表现出较高的一般配合力；三亚与北海组合的特殊配合力较高；三亚．徐闻组合的壳长平均杂种优势大于壳高的杂种优势，而三亚-北海和徐闻-北海两组和的平均杂种优势则壳高大于壳长。从表型平均值看出，有北海亲贝参与的杂交组合无论壳长或壳高性状都生长都较快，但其作为父本的表现优于作为母本，北海亲贝的平均母性效应值为负。
5、稚贝实验生态研究研究了稚贝的环境适应性和附着特性，结果表明：合浦珠母贝稚贝的pH最适范围为7.5～8.5，低于6.5或高于9.5则不适宜稚贝生存；稚贝适宜盐度为15～40，最适范围为30～40；附着试验表明，大多数稚贝位于水体上层，占66.6％，向下逐渐减少；塑料板正面附苗量随水层加深逐渐减少，反面则变化不大；底层附着板正反两面的附苗量相差不大。稚贝在黄色塑料板上附苗量最大，而黑、绿和红色塑料板无明显差别。
6、大珠母贝遗传多样性利用6对微卫星DNA分子标记对三亚和北海的大珠母贝群体进行遗传多样性分析。结果表明：2个群体的平均等位基因数A分别为10.50和9.67，平均有效等位基因数Ne为7.01和6.33，平均观察杂合度Ho为0.588和0.445，平均期望杂合度He为0.859和0.828，平均多态信息含量PIC为0.853和0.796;卡方检验发现只有位点Pmx+022、Pmx16.41和Pmxl6.23在三亚群体中符合Hardy—weinberg平衡(P＞0.05)，其他位点在2个群体都有不同程度的偏离。