近年，中国正加快实施创新驱动发展，在创新产业、创新业态等领域持续发力。在创新驱动发展战略中，科技企业孵化器是至关重要的参与主体，而国家级科技企业孵化器是孵化器的核心构成部分。因此有必要探究国家级科技企业孵化器的运行效率与区域差异，找出关键影响因素，提高孵化器的产出与运行效率，进而强化创新对经济发展的支撑作用。
　　首先，本研究以中国的国家级科技企业孵化器为研究对象，基于2013-2017年中国30个省、市、自治区的面板数据，从人力、场地、资金三个维度构建多元化的效率评价指标，运用改良后的三阶段DEA模型对中国各省市国家级科技企业孵化器综合技术效率、纯技术效率、规模效率进行测度；其次，针对不同地区的国家级科技企业孵化器效率进行对比分析和趋势分析，分析影响因素对效率的作用机理；再次，通过空间滞后模型探究各地区国家级科技企业孵化器效率的区域性差异，探究空间依赖性与空间溢出效应，并从创新水平、教育水平、城市化水平、贸易自由度与金融水平五个方面探究影响因素；从次，采用Tobit回归模型，进一步证实中国国家级科技企业孵化器效率的影响因素；最后，根据实证分析结果，提出有针对性的政策建议。
　　本研究发现，国家级科技企业孵化器效率呈现较为显著的差异化。不同地区的综合技术效率、规模效率与纯技术效率不同；存在显著的正向空间依赖性，创新水平、教育水平、城市化水平、贸易自由度与金融水平均会产生正面影响。在提高国家级科技企业孵化器效率时应充分考虑空间效应与集聚效应，提高创新水平、优化人才教育、加强城镇化建设和完善金融等激励政策，完善运作管理、提高孵化器效率，促进创新创业活动有序开展。